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學術搜索引擎

檢索期刊論文的利器：布林運算子

剛開始著手新的題目時許多人都有共同的經驗：輸入一個關鍵字來查找期刊和資料庫時，出現成千上百則條目，令人不知所從！在這眾多條目裡，與自已研究問題直接相關的論文，或許不到十分之一，若憑人力海搜再一一揀選太浪費時間和精力，這時可考慮採用布林運算子（Boolean operators）進行更有效的期刊檢索與資料庫搜尋。 如何使用布林運算子？  最常用的布林運算子是AND、OR、NOT，可用來縮小（如使用AND、NOT）或擴大（如使用OR）查詢的範圍，提高文獻檢索的效能。布林運算子並非只能搜查主題關鍵字，亦可輸入作者名字或文章類型做為檢索依據。 布林運算子可單獨使用，例如輸入第一個關鍵字AND第二個關鍵字，搜尋結果便都包涵這兩個關鍵字。也可以視需要混用布林運算子，例如輸入第一個關鍵字OR第二個關鍵字NOT第三個關鍵字，這樣一來，搜尋的結果便是有關第一或第二個關鍵字的文章，但排除了第三個關鍵字的條目。 看一下這個實例，僅用關鍵字在PubMed檢索有關HIV的研究時，出現資料多達9845則，然透過各種布林運算子的排列組合後，便能找到十數則至一百多則更具相關性的論文，節省寶貴的時間和資源。 布林運算子 關鍵字搜尋 搜尋結果 None HIV transmission intravenous sexual 2353…

7 years ago

以ReadCube管理研究論文

一波波不斷擴大的科學文獻的洪流往往利弊共存。我們能得到更多信息是很棒的事，但試圖去管理、組織和了解所有數據就不是那麼令人感到有趣了。ReadCube號稱是一項可協助研究員在這方面的作業的研究工具。 ReadCube提供什麼？ ReadCube是適用於桌面與瀏覽器的應用程式。也就是說，使用者安裝ReadCube於個人電腦後，其會從谷歌學術搜索、PubMed和微軟學術搜索去查找和下載文章。有哪些期刊可供ReadCube使用呢？相當多，包括《約翰威立》刊出的一百多篇文章，以及那些《自然》出版集團刊載的文章。你可以免費加入ReadCube，但閱讀文章可能要另外計費。除非你是訂閱用戶，否則一般來說需支付一筆租金才有48個小時的權限閱讀該文章。若你已是訂閱用戶，你可以通過ReadCube將連結發送給與你合作的研究員，他們即可閱讀該篇文章。當然，雖然人們已經擁有需多分享文章的方式，但ReadCube使分享既合法又便利。 來看看其他專家怎麼說：   ReadCube提供了多種功能，便於在個人圖書館內分類和儲存文章。該軟體在你使用服務時會記憶你的研究所需資料，並提供建議閱讀清單。整合式PDF檢視器能讓你在文章中標示重點並加入註解，補充信息更方便。 ReadCube是Sciencescape等這類提供多種類似功能服務的競爭對手。如果你是ReadCube合作期刊的訂閱用戶，這些服務或許有幫助；否則其實用處不大，因為大多數的文章僅供付費下載。 我稍微試用過ReadCube，但並無更進一步使用。ReadCube註冊用戶程序簡單，但當我下載軟體時，防毒軟體跳出了危險信號，警示其可能內含病毒。無論如何我還是下載了，但卻無法啟動它。ReadCube客戶支援指南建議 (1) 關閉我的防毒軟體，或 (2) 透過複雜的步驟安裝ReadCube程式，但最後我決定放棄。雖然我並不屬於這世上精通電腦的人，但上個月我註冊成為Sciencescape的使用者，在下載和使用方面完全沒有問題。就此看來，我認為Sciencescape在用戶親和性上略勝ReadCube一籌。 有機化學博士，美國 6以上年科學與醫療寫作經驗  …

11 years ago

「GOOGLE SCHOLAR」到底好不好用

GOOGLE SCHOLAR（以下簡稱為GS）是GOOGLE於2004年11月推出的學術搜索引擎，在推出同時產生了極大的反響並做出不少承諾，研究學者和學生期待GS能像是普通GOOGLE搜索一樣，但卻發現GS的搜索結果是有局限性的。十年的改善，GS的確有一定程度的進步，然而問題依舊存在：究竟在使用GS時，我們是否應該信賴GS對所選主題提供文獻搜索的結果與嚴格、系統的評價？又該信賴到何種程度？ 1.     用戶投訴和挫折 若是將用戶的投訴和挫敗感的來源都分門別類，那麼大致是下面的分類： 學生抱怨，認為自然科學在GS中，相較於社會、人文科學，有著明確的主導地位。 學生往往都希望能找到某文獻的全文文字版，但都只能找到不同來源的同一縮減版，這使得分辨文獻版本究竟是不是官方版，又或是其他的什麼版本變得異常困難。 學術圖書館員也因為無法過濾出劣質歛財期刊的內容，或是開放取閱的文獻資料而感到挫折，因為在GS上的文獻是否經過同儕審查步驟並沒有被明確的標示出來。 進行研究的科學家則是抱怨GS只有在你確認自己要尋找什麼的時候才好用，在剛開始進行文獻綜述的編譯時基本上用不上。 2.     是個工具，就有其用法 最好的建議是謹慎行事，因為GS並未致力於篩選劣質歛財期刊內容何其他偽科學來源，所以你的搜索結果也可能是學術質量低下的文獻。 GS終歸是個寶貴的資源，就像維基百科一樣，即便是有爭議，但是使用得當的情況下也能事半功倍。 GS可以作為拓展文獻綜述思路的工作，可以用來尋找同儕審查的相關參考資料，也可以拿來搜索已知的特定的文獻，但如同維基百科一樣，別在沒有進一步考證之前直接列入文獻來源就是了！

11 years ago

Sciencescape有助於研究人員瞭解最新文獻嗎？

科學出版業興起的一個不利之處是它提出了研究人員力圖瞭解研究領域最新成果的問題。人們不可能查閱特定領域出版的所有論文。如何篩選大量材料，取其精華，去其糟粕呢？初創公司Sciencescape旨在幫助研究人員實現這一目標。   Sciencescape：參考檢索等 Sciencescape生物醫學領域有新舊論文2200萬份可供使用。用戶選擇一個或多個興趣領域——基因、藥物等，然後搜索論文數據庫。其他可供搜索的數據庫也有這種功能，不過Sciencescape的功能更進一步。Sciencescape還提供各種工具，讓客戶在文獻庫中存儲參考文獻，方便與其他研究者共享論文。   讓我們看看專家如何看待Sciencescape： 這項服務提供了一種簡單方法來理清每日出版的大量新論文。 Sciencescap是一款優秀的工具，可以幫助研究人員瞭解最新的相關研究。Sciencescape的重點在於幫助研究人員把握數字時代科學研究的大規模增長。這項服務提供了一種簡單的方法來理清每日出版的大量新論文。通過使用實時文章分類算法組織興趣領域出版物，Sciencescape讓研究人員始終站在相關工作研究的最前沿，並解決出版物過量的問題。 除了容易找到新研究之外，Sciencescape還提供數據可視化，讓科學家更容易瞭解研究領域的趨勢，產生新穎的選題思路。它還讓研究人員更容易通過挑選特定文獻庫的論文，並結合聯合參考文獻庫來組織各自的項目論文，以便團隊成員保持研究工作一致。 跨學科研究碩士 美國，六年以上研究與學術編輯經驗 這種工具可以幫助即時瞭解最新研究的當前狀況和概念背景。 查閱文獻是一件耗時的工作，也是一件研究者必須全力以赴的工作。以前，這項工作包括生成關鍵詞組，在隱含相關論文的眾多數據庫中進行搜索。系統審稿員也可以採取正式策略，在數據庫搜索中查找、添加、結合關鍵同義詞和不標准的詞語用法，確保充分提取文獻中符合嚴格綜合分析標準的數據。在迅速擴大的文獻庫中，Sciencescape能夠用特徵因子和隨機游走數學運算將這一過程自動化，產生良好的省時結果。隨後使用圖形介面可以提供任何主題的快速縱覽，並根據引文網絡中可以搜集到的大量真實觀點來確定特定含義的時間和發現。這種工具可以幫助即時瞭解最新研究的當前狀況和概念背景。一些保守的研究人員可能會懷念從提出統一的限定問題到付諸印刷之間的漫長思考過程，一些人可能會懷念郵遞訂閱的必要性，但沒人會忽視這種工具處理特定研究領域的實用性和時新性。然而，在新觀點和矛盾觀點的層面上，Sciencescape可以鬆解教條和限制較大影響力研究對標準制定的發展，這能夠反映出大眾的興趣或者商業利益，而不是真實性。 癌症博士 澳大利亞，12年以上的科學與醫學寫作經驗…

11 years ago

如何有效使用Google學術搜索？

我們通過校園圖書館系統可以找到很多優質的期刊著作，然而當沒有辦法接入學校網絡時，查找可靠的學術信息就成為了一個問題。Google學術搜索是Google公司2004年推出的一個可以免費搜索學術文章的網絡搜索引擎。從它面世之日起，Google學術搜索就已經包括了世界上絕大部分出版的學術期刊。這次我們就為大家介紹一下如何有效地來使用Google學術搜索。 Google學術能搜索什麼 Google學術搜索涵蓋了來自多方的信息，包括有萬方數據資源系統，維基諮詢，主要大學發表的學術期刊，公開的學術期刊，大學的論文以及網路上可以搜索到的各類文章。Google學術搜索同時還提供了中文版界面，供中文學者更方便的搜索全球的學術科研信息。例如，如果您在寫有關生物工程論文的學生，只要在Google學術搜索框中輸入RAPD，你就可以獲得與研究主題相關的原始研究文獻，文章以及書籍的列表。 Google學術搜索的優點 和Google網頁搜索一樣，Google學術搜索根據相關性對搜索結果進行排序，最相關的信息會顯示在頁面的最上方。這一排序對應考慮每篇文章的全文內容，作者，發表該文章的刊物，以及該文章被其他學術著作引用的次數等要素。此外，Google學術搜索會搜索全文，而不僅僅是摘要部分，因而學者可以對學術內容做全面深入的二次搜索，加強了搜索結果的相關性。更獨特的一點是，Google學術搜索還包括了沒有在線發布的學術研究結果。比如愛因斯坦的很多著作並未在線發布，但卻被眾多學者引用。Google學術搜索通過提供這些引用信息使搜索者了解到重要的未在線論文和書籍。 如何使用Google學術搜索 對於不同的研究任務，Google學術搜索可以進行文獻作者搜索，出版物待定搜索，特定時間文獻搜索以及交叉搜索。作者搜索當然簡明易懂，如果知道要查找的文章作者，我們只需要把姓氏添加到搜索字詞中。例如，搜索Friedman Regression就可以查找到所有弗里德曼寫的關於回歸的文章。如果我們明確的知道學術著作，論文或報告的標題，就可以查找到更準確的學術信息，我們只需要在搜索編輯框中輸入加英文引號的標題，然後單擊搜索按鈕。出版物和日期限制都只出現在“高級學術搜索”頁中。出版物限定搜索只返回來自特定出版物，針對特定關鍵字詞的搜索結果。日期限制則會幫助學者找到有標誌出版日期的文章，例如尋找2005年之後出版的超導薄膜方面的文章。 總之，Google學術搜索具有針對性，專業性並有效地通過全文內容，影響度來排序。這些可以潛在的幫助學者們來對學術資料價值進行初步評估。Google學術搜索也包括一些高級的搜索限定，我們在這裡沒有講到，但是你可以登錄Google學術網站來看一看各類不同的高級用法，更快捷高效的來做研究。

12 years ago

網路工具讓研究過程輕鬆起來

網路時代對於學者研究過程不啻是一個福音，再不用埋頭於山一般高的書堆尋找需要的文獻，但即便是消除了地域限制和網路保證了資訊普及，也不保證在搜尋引擎上千萬筆關鍵字搜索結果中，頭一個就是你所需要的。如今出版商如雲、作者自由選擇付費取閱和開放取閱期刊，讓調查研究過程有挑戰性！因此搜索過程除了使用正確的關鍵字之外，不同的網路工具和搜索引擎也會有結果上的差異。以下就簡單介紹一些能讓研究過程輕鬆起來的一些工具： 中文論文資料搜索引擎 Google學術搜索：事實上這可以用中文和英文同時搜索，部分論文有全文，但引用前要認真看清楚引用條款，有時候需要作者同意。 台灣博碩士論文知識加值系統：裡面收錄不少台灣博碩士論文，簡單註冊就可以查詢。 CEPS論文圖書館：付費的論文資料庫，有些學校有購買權限，可以直接下載電子檔全文。 科技論文在線：簡體網站，文獻經過專人審查後才允許上線，相對有品質保障。 英文論文資料搜索引擎 PubMed：生物醫學相關論文搜索引擎，提供全文付費或免費鏈接，詳細使用方式見過往文章「PubMed期刊論文搜尋引擎」。 CiteSeerx: 電腦資訊科技相關論文搜索引擎，提供免費論文下載，算是開放取閱的先驅。 Science Direct： Elsevier的全論文搜索網站，免費註冊，部分全文需付費的論文庫，部分學校有付費權限。 Scopus ：Elsevier的引用和摘要搜索網站，必須由學校或研究機構註冊後使用，如果沒有權限也可以從作者預覽頁面搜索，對於需要尋找特定論文也很有幫助。…

12 years ago

ChemSpider 免費化學搜索引擎

2007年首次公諸於世的ChemSpider是化學結構免費搜索引擎，自2009年屬英國皇家化學會（Royal Society of Chemistry，簡稱RSC）所有。 ChemSpider有以下幾項特點： 數據庫—整合超過400個數據來源，擁有2千5百萬以上個化學結構、性質和相關資訊。 搜索選項—一般搜尋包含系統命名、商品名稱、同義字和登錄號；進階搜尋則以互動搜尋方式，包含了化學結構、次級結構、分子式、分子量範圍、CAS編號、供應商等等搜尋選項（圖）。 線上服務—包含化學名稱結構轉換、SMILES和InChL字符串的生成、物理化學參數與核磁譜圖的預測等服務。   網路上有不少ChemSpider使用教學，可參考例如：AntonyWilliams的slideshows。 另外，自2010年ChemSpider新增了專為合成化學研究者設計的ChemSpider SyntheticPages （CS|SP），可搜尋化學反應以及提供可重複反應的文獻、同儕審查和語義擴充；使用者並可登入系統撰寫評論，以收集實驗室內化學合成操作的實用經驗。   參考資料：…

12 years ago

ChemxSeer化學搜索引擎

ChemXSeer為整合化學類科學文章的公共數位圖書館和搜索引擎，是由美國賓州州立大學跨領域研究團隊開發，ChemxSeer專案則是由美國國家科學基金會（NSF）資助開發經費。 ChemxSeer有幾項不同於傳統搜索引擎的功能： Chemical Entity Search—可辨認化合物分子式和名稱，並與一般用詞作區別；使用相似度得分、功能排名和搜尋方法來索引不同化學個體。 TableSeer—能自動辨別數位檔案裡的圖表，並萃取表格的中介資料（Metadata）及表格內容，以供使用者搜尋。 Databases—可整合不同來源的實驗數據，並可處理多種檔案格式，例如XML、Mircrosoft Excel、Gaussian、CHARMM；從中建立可直接搜尋的資料庫，利用標記工具建立Metadata，並建立資料組間的連結。 ChemxSeer使用者可利用關鍵字、分子式或化學名稱，搜尋超過44,500件化學文件；另外，也可使用下圖橫列的幾種資料型式進行搜尋；系統並可搜尋excel資料（”Kinetics Database”）及所有計算資料（”All Types”）。     其他功能包括Table Extractor可萃取上傳表格內容，並有ChemxSeer…

12 years ago

WorldWideScience科學搜索引擎

WorldWideScience.org 為一個能搜索全球科學資訊的門戶網站，是由隸屬美國能源部的科學與技術資訊辦公室（Office of Scientific and Technical Information）開發，網站於2007年開張。 WorldWideScience.org 的幾項特色和優點： 整合全球現有超過70個會員國的WorldWideScience聯盟的科學數據庫，可一次同時搜尋所有檢索系統中的科學文獻。 連通一般網路搜索引擎無法搜尋的「暗網」科學資料庫。 多語言即時搜尋和翻譯，包含中文、英語、法語、德語、日語、韓語、西班牙語、葡萄牙語、俄語、阿拉伯語等10種語言。 * 例如下圖所示，若於搜尋時點選「中文」，則結果頁面右上角會顯示「翻譯結果」按鈕，點選後所有的搜尋結果內容便會自動翻譯成中文，方便中文使用者查找。須注意的是，此網頁的中文為簡體中文，有些學術習慣用語可能與台灣有些差別，所以不確定的地方，還是建議同時參考英文或原文內容。 多媒體搜尋功能，可搜索語音科學多媒體資料庫，如ScienceCinema等等。…

12 years ago

SAO/NASA ADS天體物理資料庫

SAO/NASA天體物理數據系統（ADS）是由美國太空總署（NASA）開發，1992年正式公開亮相，目前由Harvard-Smithsonian天體物理中心／Smithsonian天體物理觀測臺（SAO）負責系統運作。 ADS是天文學界最普遍使用的搜尋網站， 對加速全球天文研究發展一直扮演著重要的角色。     ADS有三大書目資料庫：天文和天體物理學、物理學以及arXiv電子資料；共有970多萬筆資料。其中大多數的文獻摘要都可免費線上搜尋，較舊的文獻一般有GIF或PDF的掃描版本可查看，較新的文章則可連結至該發表期刊的網頁，ADS目前共有超過9400萬的對外連結資源。 ADS主要提供兩種搜索方式，Search或Browse。使用者可以在「Search」選項下進行基本關鍵字搜索；可查的關鍵字包含作者姓名、天體名稱、標題、摘要內容等，搜尋結果一樣可以過濾或分類（如下圖右上角）。另外，查詢結果除了顯示基本的摘要外，右半邊的英文字母可連向其他許多附帶的相關資訊，例如R是reference，C是citation等等，只要把游標移到字母上便可了解其代表意義。     值得一提的是，其中的U指的是Also-read，意思是閱讀該篇文章的人也看了哪些文章；這可幫助使用者了解其他研究人員感興趣的題目是什麼。而S(SIMBAD)以及N(NASA Extragalactic Database, NED)則可提供文中分析的天體的基本觀測資訊，並可繼續連向其他關於該天體的文獻。 「Browse」選項則可依下圖中5項不同方式進行文獻搜尋，可查找期刊文獻、文件掃描檔和書籍等。  …

13 years ago

PubChem化學文獻搜索引擎

2004年開張的 PubChem 是專門針對查詢化學分子與生物活性的搜索引擎，系統由隸屬美國國立衛生研究院（NIH）的國家生物技術資訊中心（NCBI）維護，擁有上百萬組化學結構和相關文字資料，並可免費經由FTP下載。 從網頁編排便可得知，PubChem主要有Compound、Substance、BioAssay3種資料庫： Compound包含結構已知且少於1000個原子和1000個化學鍵的小分子化合物 Substance除了純化合物外，還包含混合物、萃取物、絡合物以及結構未定的物質 BioAssay包含1644項高通量篩選計畫的生物活性數據 PubChem除了有與PubMed相似的文字搜索功能（請參考「PubMed期刊論文搜尋引擎」），還提供多種符合化學研究者需求的貼心搜索功能，例如化學結構、名稱片段、化學式、分子量、脂水分配係數、氫鍵給體和受體數等，除此之外，還可線上畫結構或片段來作搜尋，並有CID, SMILES, InChI系統可輸入和輸出所有常用化學檔案格式。 而每筆搜尋結果包含同義字、化學特性、化學結構、生物活性、相關化學結構、其他NCBI數據庫（例如PubMed）的網頁連結等有用資訊。 PubChem目前是化學界學者熟知的美國化學學會（ACS）化學文摘服務搜索系統（cas.org）的最大競爭對手。   參考資料： PubChem化學文獻搜索引擎…

13 years ago

GoPubMed生醫搜索引擎

我們之前提過的「PubMed期刊論文搜尋引擎」，經年累月以來，已有超過1千5百萬的生醫類文獻；然而，資訊量過大隨之而來的問題便是無法有效率地找到想要找的文獻。為了解決這方面的問題，德國德瑞斯頓工業大學（Technical University of Dresden）與Transinsight公司於2005年共同開發了GoPubMed網路伺服系統。 GoPubMed利用Gene Ontology（GO，基因本體）理論來對PubMed資料庫進行標籤及搜尋。GO是一項生物資訊專案（請參考Gene Ontology website），目的是統整生物領域間對基因和基因產物的用語，改善學術溝通、資訊分享等問題。GO包含三個部份： Cellular component—細胞的組成「零件」和細胞外環境 Molecular function­—基因產物的分子功能，例如結合或催化 Biological process—生物體內與特定生物功能相關的分子過程 GoPubMed使用GO原則分類各文獻的摘要，GO分類標籤並顯示於所有搜出的文獻上，讓使用者能依照分類快速掃過各摘要，大大減少找到想要的資訊的時間。…

13 years ago