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開放近用

打破知識壁壘：開放獲取期刊給醫學研究帶來的變革

醫學研究是醫療進步的關鍵，為探索疾病原理、治療和患者護理方法提供見解。在醫學研究傳播中，從封閉獲取（closed access）的期刊轉向開放獲取（open access）的出版是最革命性的轉變之一。本文將探討開放獲取在醫療領域的重要性，並提供對其持續發展的建議。 為什麼在醫學領域中開放獲取是極其重要的？ 在現代醫療領域，開放獲取已經成為一種至關重要的趨勢，它代表了對研究論文無任何限制的訪問權。這意味著醫學知識和重要的研究成果不再被封鎖在高額訂閱費用的牆後，而是對全球的醫生、研究者和公眾開放。這種模式不僅代表了資訊訪問的民主化，更是鼓勵了跨學科和跨國界的研究合作。這種無阻礙的知識共用方式確保了科研人員能夠迅速分享和獲取新的發現，從而加速醫學進展。在醫學領域，尤其是當我們面臨緊迫的全球健康危機時，每一項科研發現都可能對數百萬生命產生影響。因此，能夠迅速、準確和廣泛地獲取和傳播這些資訊尤為重要。 傳統的封閉獲取期刊及其局限性 歷史上，學術界，特別是醫學領域，都習慣於封閉獲取的訂閱期刊中發表研究成果。這些期刊要求訂閱者或相關機構支付相當高的費用才能獲取其學術內容。顯然，這種模式對於知識的傳播形成了巨大的障礙，因為它實質上將知識的獲取許可權限制在了那些經濟實力雄厚的人或機構中。這意味著，大量的研究者、醫學專家、學生以及廣大的公眾都無法接觸到這些寶貴的資訊和發現。更為糟糕的是，很多研究者在投稿這些期刊時，還需要支付高額的出版費用或處理費，這進一步加劇了經濟上的壓力。這種經濟負擔不僅抑制了研究者的積極性，還可能阻礙了一些可能對整個醫學領域產生重大影響的突破性研究的廣泛傳播。 醫學研究中開放獲取的益處與前瞻性 所有利益相關者的全面可訪問性: 開放獲取的模式打破了知識的經濟壁壘，確保患者、醫生、科研人員、政策制定者以及廣大的公眾都能夠自由地獲取並從最新的醫學發現中受益。以發展中國家為例，其中的許多患者和醫生由於經濟原因往往難以獲得最前沿的醫學知識，但透過開放獲取，他們現在可以毫無障礙地瞭解並應用最新的治療方法和策略。 促進科學進步的加速: 開放獲取不僅使得研究內容更容易被全球範圍內的研究者獲取，還大大刺激了學術界之間的合作與交流，這種合作為科學領域帶來了更為迅速的突破和進展。一個顯著的例子是在COVID-19大流行期間，眾多的開放獲取論文促成了國際間快速而高效的研究合作，加速了對疾病的瞭解和應對。 經濟上的成本效益和長期可持續性: 開放獲取模式避免了昂貴的訂閱費用，這使得許多教育和研究機構能夠將寶貴的資金用於其他更為關鍵的領域，如基礎研究或基礎設施建設，這確保了醫學研究在長遠的未來都可以持續並廣泛地傳播。 擴大研究的可見性和社會影響:…

2 years ago

資料庫連結文摘（overlay journal）的興起與發展

資料庫連結文摘（overlay journal）是在傳統訂閱期刊、開放獲取期刊、文獻檢索資料庫、預印本資料庫之後出現的第五種文獻交流形式。這一概念於1996年首次提出，距今已有25年。它本質上是一種按照某個主題編纂導讀的開放獲取期刊論文標題及網頁連結的免費清單，屬於文摘彙編的性質。Overlay journal按照英文直譯的意思是覆蓋式期刊。所謂覆蓋（overlay）的意思是涵蓋大量資料庫的論文。使用期刊（journal）這個詞的本意是想表達從期刊裡選擇論文。但是，overlay journal這個英文稱呼並不準確，而且具有誤導性，不宜使用，需要糾正。這種文獻的實質並不是期刊，而是開放獲取期刊或預印本資料庫中的論文的標題網址彙編。因此，它既不具備期刊的接受投稿和同行評議的核心特徵，也不具備刊載論文全文的核心特徵。它其實是一種按照專題編纂的二次文獻檢索結果列表。所以，將它稱為資料庫連結文摘是最適宜的稱呼，英文名稱應該改為overlay digest（OD）或journal paper link digest（JPLD）。下面對該稱呼中的每個要素進行剖析，包括期刊、連結、文摘、資料庫，並論述這種文獻交流形式的興起原因和發展前景。 首先，需要澄清期刊的概念。眾所周知，無論紙質期刊還是線上電子版，傳統期刊（又稱傳統訂閱式期刊）接受作者投稿，發表經過同行評議的論文，期刊出版社擁有版權。由於傳統期刊通常已經是某個領域精選出來的論文，所以傳統期刊很少將論文再篩選彙集起來發表第二次。如果有集中於某個專題發表論文的需求，傳統期刊通常採用出版特刊或專刊的形式徵稿發表論文。 當期刊價格上漲過高，從而導致開放獲取運動興起後，出現了開放獲取（Open Access，簡稱OA）期刊。傳統期刊與OA期刊的主要區別在於，前者是讀者付費訂閱、作者通常免費發表論文，而後者是讀者免費閱讀、作者通常付費發表論文。傳統期刊與OA期刊都需要經過同行評議，而且都刊載論文的全文。傳統期刊論文的版權通常歸出版社所有。OA期刊論文的版權通常歸作者或出版社所有，並且在論文的使用權限方面比傳統期刊寬鬆很多。 關於連結和文摘，有兩種形式。第一種是摘錄式文摘，即從某篇論文的全文中摘錄某一部分內容，例如摘要、引言或結論。最常見的摘錄式文摘是彙集各種二次文獻的摘要檢索資料庫，例如SCOPUS。第二種文摘是按照某種彙編標準或專業主題摘錄論文的摘要，稱為摘要式文摘。第三種文摘是資料庫連結文摘這種標題連結式文摘，即從很多篇論文中按照某種彙編標準或專業主題摘錄論文的標題或標題及網頁連結，但是由於版權限制而不摘錄每篇論文中的具體某部分內容。由於讀者自行使用SCOPUS（摘要資料庫）等資料庫進行檢索非常方便，另外由於人們尚未意識到專業文獻導讀的重要性，因此目前尚未大規模出現按照某個專題編纂的論文摘要文摘和論文標題連結彙編這兩種文獻交流形式，例如“自動加工技術2015-2021年經典論文精選摘要（或標題）彙編”。資料庫連結文摘應讀者的要求，將各個開放獲取資料庫中的論文的標題和全文網頁連結按照某個主題（例如“自動加工技術”）彙編在一起，定期或不定期發佈。另外，由於已經使用了讀者可以免費查看的OA期刊或預印本的全文連結，因此沒有必要添加摘要，這樣還可以規避摘要版權歸屬的問題。 摘要檢索資料庫與資料庫連結文摘之間的第一個區別是前者只發佈摘要，讀者並不能看到全文，除非是解決了版權問題的全文資料庫；而後者由於調用開放獲取期刊的網址，讀者可以免費查看論文全文。它們之間的第二個區別是前者沒有按照專業主題進行細分編纂，而後者的核心價值就在於按照專業主題進行細分、選擇、評議和編纂，例如編著者作為專業導師或文獻提供服務者指導讀者在某個特定專業領域閱讀一批經典的精選論文。毋庸置疑，從事這種專業編纂需要具備高深的專業知識，並可能能夠提供巨大的專業指導價值。因此，資料庫連結文摘是具有強烈需求和重要存在意義的。期刊、預印本和檢索資料庫的作用是提供論文全文和找到全文的檢索方法，但是它們並未解決應當閱讀哪些專業文獻的問題。資料庫連結文摘的作用恰好是或者說應該是解決根據專業導師的推薦意見應當優先閱讀哪些文獻的問題。而且，這種將論文標題編纂在一起的彙編內容具有編著的版權價值。因此，資料庫連結文摘具有廣闊光明的發展前景。 學術交流的資料庫包括五種。第一種是經過同行評議的傳統訂閱期刊的論文全文資料庫。第二種是經過同行評議的開放獲取期刊的論文全文資料庫。第三種是沒有經過同行評議的作者自行上傳的論文全文資料庫，例如預印本資料庫。第四種是只檢索和展示論文摘要的二次文獻資料庫。第五種就是資料庫連結文摘，它主要展示論文標題和全文的網頁連結。由於版權限制，這種網頁連結的全文必須是開放獲取期刊的論文或預印本論文，並且必須是線上的電子版資料。 關於標題連結文摘的功能和價值，通過以上分析可見資料庫連結文摘（overlay…

4 years ago

大學應加入Plan S，停止出版商的箝制！

歐盟11個國家在2018年聯合簽署了Plan S。這項協議是在甚麼樣的背景產生、意義為何，將會帶來甚麼影響？ 研究生或學者可能都有相同經驗：好不容易找到了一篇對自己的研究非常重要的論文，但學校圖書館卻沒有訂閱這份刊物，因而無法閱讀這篇關鍵文章。 出版商把持知識的流通 造成研究者取得學術論文的最大障礙，在於各大學圖書館遭受學術出版商高價箝制，不僅訂價過高，並強制圖書館不能單獨訂閱特定期刊，必須依照出版商組合的套餐期刊照單全收。 大學開始退訂出版商的套餐期刊 面對出版商長期的壓榨，近年來從歐洲到美國，都有越來越多的大學圖書館，退訂學術出版集團強行搭售的期刊套餐。舉例來說，佛羅里達州立大學去年宣布，自2019年起，不再與Elsevier學術出版集團續約，原因便是Elsevier的指定套餐訂價昂貴，且價格不斷逐年上漲，佛州大學決定退出這種不合理的合約，轉而根據校內研究者的實際需求，分別訂閱最恰當的特定刊物。 另外，挪威高等教育暨研究聯合機構（簡稱UNIT），今年三月與Elsevier談判破裂，雖然Elsevier同意為挪威的研究機構降低部分售價，但UNIT認為，出版商對於提倡免費使用學術出版品的努力仍遠遠不足，與挪威立意推動的政策不符，因此UNIT所屬的各大學及研究單位，自2019年與Elsevier的合約到期之後，將不再續約。 什麼是Plan S? 自由的資訊傳播是學術研究的基石，如此科學家才能站在前人的肩膀上不斷創新，為人類共同面對的問題找出更有效的解決之道。 為了達到上述理想，11個歐盟國家於2018年聯合簽署了Plan S，從2020年起，簽署國公費撥款支持的研究，都必須發表在開放近用期刊或出版平台，以便讓更多人能夠無償接觸到研究的出版成果。在Plan S的壓力之下，學術出版商必將重新調整運作模式。 中國知網的壟斷爭議…

6 years ago

Plan S大步邁向學術論文全面開放，轉化性協議大受討論

近年來，如何打破付費牆（paywall），讓由公費支援的學術成果不受阻礙地傳播，已成為科學界熱門話題。許多團體應運而生，歐盟多國發起cOAlition S，致力於推行開放近用普遍化，在2018年底提出Plan S倡議（S計劃），向此目標大步邁進。而為了達成此目標，各大學術出版社必須重新訂定與學術界的協議，一步步取消訂閱收費的模式。 Plan S 簡而言之，Plan S要求於2020年1月開始，由其成員提供經費支持的所有研究，都必須發表於合其10項準則的開放近取平台。 cOAlition S目前包含15個國家機構及4個基金會，參與國家機構已不僅止於歐盟：奧地利、芬蘭、法國、愛爾蘭、義大利、盧森堡、荷蘭、挪威、波蘭、斯洛維尼亞、瑞典、英國、贊比亞、約旦；基金會則包括英國的Wellcome、美國的蓋茨基金會（Bill & Melinda Gates Foundation）、瑞典的Riksbankens Jubileumsfond、義大利的Compagnia di…

6 years ago

Everything You Need to Know about Open Access

With the advent of the internet and emergence of digital archiving, access to information has…

6 years ago

A Researcher’s Guide to Preprints—Importance & Benefits to Authors

This webinar provides insights on how preprints can improve scholarly communication and academic publishing.

7 years ago

研究人員宣布抵制關閉存取功能的新自然期刊Nature Machine Intelligence

自然期刊(Nature)是世界上最負盛名、極具權威的科學期刊之一，旗下有個新的期刊～機器智慧期刊(Nature Machine Intelligence)，此期刊自2019年1月起創刊，每月在線上出刊，而且只從事線上出刊，主要是因應快速變遷的領域，因而從事網路化的出版。但是隨著令人振奮的創刊之後，卻也引起了不少罵聲，因為該期刊要收取費用，因而關閉了開放存取的功能。

8 years ago

了解您的領域中的熱門開放近用期刊

開放近用（OA）出版不僅有助於提高研究的知名度和影響力，而且還有助其更快地向學術界傳播知識。根據2015年STM報告，在2014年有2.8萬篇具有同儕審查的英語系期刊和6,400篇具有同儕審查的非英語系期刊。此外，在開放近用期刊（DOAJ）目錄中的開放近用期刊數量也顯著增加。

8 years ago

解決生科論文再現性過低問題的推薦方案

在科學研究中，在對研究結果作自我糾正、歸納，或是演繹推理，會透過複製實驗的結果來確認其再現性 (reproducibility) 。如果研究的結果被證明是不可重複的，這表示之前的研究應該重新檢視，所以再現性是一個論文成功的重要指標。 由於生命科學領域的特殊性，摻雜了許多複雜的因素，目前在學界所面臨最棘手的問題就是再現性太低。目前學界統計論文的可複製性最多也只有40%，甚至於隨著不同機構的研究也有低達30%到20%的；根據Nature期刊對1576名研究人員進行的一項調查，超過70%的研究人員會試圖重製另外一個科學家的實驗，結果是失敗的；而研究人員重製自己的實驗，一半以上是失敗的。 再現性太低是很嚴重的，會影響到可信度 (credibility)，當一篇論文無法再受到信任以後，那麼影響就相當深遠了。不管是研究人員或是研究機構，再也無法受到信任，那麼接續下去的計畫也有問題，影響最大的莫過於金主的挹注。當研究計畫缺少資金，那就再也無法進行下去了。 這種再現性危機 (reproducibility crisis)，是不是在說明再現性在生命科學這個領域中可能不是最適合的評估標準呢？科學驗證的方法其實不只一種，那麼學界是否也要積極的找別種方法？當整個學術走進一個死胡同，是不是應該找出一個出路呢？就當今生科研究的實驗複雜性而言，其實再現性並沒有一定的標準。   這幾年來三角交叉法 (triangulation) 逐漸被採用。三角交叉法，或稱多元交叉法 (multiple triangulation)…

8 years ago

Dissemin綠色開放近用管道突破付費牆

綠色開放近用(Green open access，Green OA)使讀者可以透過開放近用(OA)知識庫而獲取研究論文。雖然傳統型(訂閱型)期刊的同儕審查過程依舊保持不變，但已發表的研究論文版本現在已可透過Green OA獲取。學術期刊會決定哪些版本的論文可以透過Green OA獲取，因為他們擁有最終出版版本的權利。Green OA應該與Gold OA加以區分。在Green OA中，文章可以在出版商網站以外的地方免費獲取，例如大學知識庫或研究者的主頁。 透過Green OA發布論文，會牽涉到在索引知識庫(repositories)中發布文章的多個步驟。索引知識庫是一個為了配置文件而設的儲存網站。當把文章放進索引知識庫時，讀者可以在OA期刊或混合型期刊中查閱文章。另一方面，使用付費牆(paywall)的傳統期刊只有在收到一定的費用後，才會提供發表的文章。傳統期刊出版商堅稱要採取這種策略，來保持內容的品質。有趣的是，Sci-Hub創始人Alexandra Elbakyan在OA出版的最新發展中，特別強調這一點，引起了研究界對學術期刊的關注。隨後，諸如Dissemin之類的工具，現在以Green OA的方式，提供對期刊文章的近用。   Dissemin的開放近用工具…

8 years ago

研究揭露隱蔽達50年的蔗糖對健康之祕

現今，攝取糖量應小心節制的這個觀念已經廣為人知。蔗糖對健康的不良影響到近年被確立，堪稱為健康公敵。事實上早在50年前，便有糖類與健康的相關研究進行，只是結果被輕描淡寫，攝取蔗糖與提高心血管疾病風險之間的關聯被模糊帶過，這些研究的資助者便是製糖產業，他們包裝了這個研究成果，將其轉為對銷售糖相關製品的有利敘述。 在1967年，糖攝取與心臟病風險上升的關聯正存在著強烈爭議。對ISRF（國際糖研究協會）內部文件進行研究的人員指出，當年由ISRF資助的一項研究，實驗結果攝取蔗糖的小鼠血中三酸甘油酯較攝取澱粉食物的小鼠更高的事實，被ISRF隱蔽不發，並中止了對這項研究的資助。 血中脂肪量增加，正是心臟病的高風險因子，若這項結果能早日確定，這項科學上的爭議應可早日平息，在對人類健康的意義方面影響更鉅，有更多人可為自身健康多點警覺與控制飲食，以降低心血管疾病的風險。然而由於利益考量，這個延遲了50年才揭露的研究結果，使得高糖飲食與心血管疾病具有關聯的這項爭議成為多年來懸而不決的一個問號。另一項由ISRF資助的259號研究，蔗糖於小鼠腸道健康影響更顯示，攝取蔗糖對膀胱癌風險升高具有關聯。這項研究同樣地在計畫完成前夕便停止了資金補助。 這個延遲的研究結果，在科學的後續研究而言也是嚴重的損失，科學家本可繼續推進糖類與心血管疾病的進一步關係，也可探討所攝取糖類品質與癌症進展的關聯，並對蔗糖與澱粉在健康上的關係作更深入的研究。 然而產業界的立場無非是希望銷售更多的糖類產品，當然不願正面證實糖對健康的不利影響。對於這項操縱科學結果的指控，ISRF的回應仍不改其立場，聲稱這僅為由一群對製糖產業反對的人士所支持的一個觀點，僅為對50年前所發生的事件的推斷與假設。過去這些研究停止的原因，與研究結果皆無關聯，而是由於計畫延遲與超支等因素。 由這次的事件放眼未來，我們還可以做些什麼來保障科學研究與公眾的利益？或許我們應該在研究中揭露資助的單位與利益衝突等相關的資訊，而政策制定者也應更重視系統化研究的改善，以避免這類因商業利益的一己之私，讓科學知識的發現與整個社會付出沉重代價。

8 years ago

如何搜尋開放近用期刊資源以協助研究工作

近年來，在網路環境成熟的推波助瀾下，開放近用（Open Access，簡稱OA）期刊逐漸得到廣泛而大量的支持。OA期刊得以使世界各地的研究者在無遠弗屆的網路世界接觸並下載、無償使用並與相關社群分享學術研究成果，使得知識得以快速傳播，人們共享文明與智慧結晶的累積並更快速地突破現有的成果與基礎。這也使得OA期刊的傳播更快更廣，並有更高的機會被引用。   OA文章的模式已於近年發展出許多類型： 巨量期刊（megajournal）：此類期刊提供了出版文章數量龐大、內容領域廣泛、文章一出刊即為開放近用的出版平台。對於作者來說，僅針對具科學性與否的客觀評議標準（因而此類期刊具有高接受率的特性）、相對來說較短的審議過程，加上較低廉的文章處理費用，是對尤其剛起步的研究者極為友善的發表平台。此類期刊的例子有：PLOS One、BMJ Open及 Scientific Reports 。 延後型（delayed）：期刊訂出特定期間的「閉鎖期」（如出版後一年內），此期間的文章仍需付訂閱費；過了閉鎖期後，文章即完全為開放近用。部分這類期刊並提供自我典藏（Self-Archiving）與綠開放近用（green open access）的選項，在此模式下，最後出版版本的文章需付費下載，但作者可將文章複本的出刊前或出刊後版本（視該期刊出版政策），置於個人網站或是所屬研究機構的資源庫。 混合型（hybrid）：這類期刊仍以使用者支付訂閱費的模式為主，但也提供作者可經由支付文章處理費而使作品轉為開放近用的選擇。 翻轉型（flipped）：原本為訂閱模式、而後轉為OA形式的期刊，這類期刊的例子有：Nucleic Acid Research 、Nature…

8 years ago