蛋氨酸成瘾：癌症的基本特征
英論閣非常高興能與世界領先的臨床前癌症合同研究組織安泰康生物技術有限公司（AntiCancer, Inc.）合作...
6 years ago
論文引用數多高才叫高被引論文？
研究人員的成就與價值是很難被衡量的，因此學術界行之有年的方法是依據發表的論文引用數來判斷。一篇優秀的學術研究發表有可能會因為傑出的實驗設計、嚴謹的邏輯推導或是突破性的發現而被大眾所熟知，而有很大的機會成為高被引論文。高被引論文越多代表這位研究人員的能力被肯定，因此可以為他帶來升等或加薪與受人景仰的好處。因此研究學者們都是在為了能夠發表高論文引用數的文章而兢兢業業地努力。 為了衝高論文引用數而採取了不當的方法 然而一昧地以論文引用數作為各種評比的標準就難免會出現鋌而走險的情況。例如在不相關的主題中大量引用自己或同儕的文章，甚至是期刊編輯或審稿人脅迫投稿作者引用自己的文章，藉此沖高論文引用數。在2019年知名學術出版社Elsevier就踢爆了一位資深學者在擔任審稿人的幾十年間，持續要求投稿作者引用自己的文章，並通過這種學術不端正行為多次被評選為高被引論文作者，直至去年才東窗事發。期刊本身無法及時發現這弊端實屬遺憾，但更殘酷的是，中間完全沒有作者敢對此惡劣的行為反抗。 究竟「多少」的論文引用數才會被視為高被引論文？ 既然論文引用數如此重要，那學術界的量尺究竟在哪裡？《自然》期刊曾經報導過在所有已出版的文章中，只有1次引用的論文，已經在前55.8％中。被引用次數達10次以上時，該文章已經是全球被引用次數中排名前24％；當超過100次引用時，論文引用數就來到最高的1.8％。當然，不同學科的平均引用數差異極大。例如在人文學科中，平均論文在10年內被引用少於一次，而在某些生物醫學領域的文章一年中就會被引用超過40次。另外從物理學領域來看，如果在2000到2010年間平均每年有約210次的引用，才算的上前1%的頂尖論文。主要是因為在不同領域中，參考文獻的平均數量和使用年限，以及該領域的新期刊總數也會有關鍵的影響。 用正確的論文引用方法來實質幫助學術生態與個人成就 正確地引用論文不僅可以增加論文引用數，更可以製造整個學術圈的正向迴圈，以下是幾個簡單但很有效果的方法： 搜尋最初發表該發現的原始作者。 確保在閱讀完整篇文章並全盤理解後才引用，以避免不恰當的引用誤導讀者。 適當引用自己先前的文章是合乎道德且沒有問題的。但同樣的，必須在確實符合該篇文章的內容前提下才可以引用。 如果可以，就儘量回避沒有實質貢獻的資深研究人員掛名發表的要求，當然這對年輕學者來說非常不容易，需要資深學者們一起來做出榜樣。 透過引用一些開放近用期刊的論文，讓此類型期刊更容易被大家發現，如此一來文章就可以觸及更多讀者。
6 years ago
期刊的影響因子孰高孰低？
研究人員常常對期刊影響因子又愛又恨，因為這些影響因子不僅被用來決定要在哪個期刊發表研究論文，還會被用來衡量科學家的價值，並影響到工作、薪水和獎勵等。影響因子是根據技術期刊進行排名的計算，演算法是過去兩年中期刊內的論文引用數。例如《自然》期刊的當前影響因子為42.778，表示在過去2年中，《自然》期刊的平均論文引用數為41次。然而這個簡單的數字已經默默地影響了大家發表期刊的選擇，導致很多人單純追求高影響因子，而不考慮該期刊的讀者或風格是否真正適合自己的研究內容。 影響因子在不同期刊的變化 基本上重量級期刊如《自然》和《科學》的影響因子都在逐年增加，差別只在於《自然》是從2010年的36.1上升至今年的42.778。《科學》則是從2010年的31.364躍升至今年的41.845，顯示能夠刊登在這兩家頂級期刊上就是論文引用數的保證，而且引用次數也持續增加。在不同領域中的各期刊影響因子差異可以非常大，例如醫學著名期刊《刺胳針》今年的影響因子達到了驚人的60.392，但是軟體工程領域最頂尖的《IEEE T SOFTWARE ENG》只有6.112，證明了單憑影響因子來判斷期刊優劣的缺陷。 為何影響因子降低了？ 一般來說期刊刊登的文章數量增加是好事，但已經有報導指出文章數量增加反而會導致影響因子降低。因為在大多數領域中，論文發表的第二年通常會比第三年得到較少的論文引用數。因此，增加刊登文章會間接造成影響因子的計算不平衡。相反來說，在其他所有因素保持不變的情況下，如果減少刊登數就可能會因為人為調整而增加了影響因子。 如何決定會變動的影響因子的真正價值 影響因子的真正關鍵在於論文引用數，但還是必須建立在正直合法的方法下累積引用數，而不是為了衝高引用數而走旁門左道。除了利用近幾年興起的開放近用(Open Access)，或是LinkedIn或是ResearchGate等知名的專業社交平台，也可以讓更多讀者認識，進而提升閱讀次數與引用率，才是增加論文引用數的正途。 是否有影響因子以外的指標供大家參考 上述介紹到的影響因子缺陷已經讓眾多研究學者認清其不是評價研究價值的唯一方法。因此越來越多的期刊採用其他方式計算，嘗試改變研究人員的觀念。例如Nature Research系列期刊採納了被引用文章的期刊品質作為考慮因素。EMBO 系列則採用了引用分佈方式，避免不當的互相引用抬高論文引用數。最近還興起了用網路分享數來計算引用數的方式。乍看之下用分享數位來評估論文影響力似乎是符合邏輯的，但是網路世界的癥結點在於許多人看都不看就把文章分享出去，這就沒有達到正確引用的目的。總而言之，目前還沒有一個完美的對論文引用數的計算方式，但是不要用簡單的影響因子就評斷一篇研究的好壞，這已經逐漸成為全球研究人員的共識。
6 years ago
How AI is Impacting Academic Publishing: Guide for Authors and Journal Editors
The application of Artificial Intelligence in the modern scientific publishing ecosystem...
6 years ago
單一論文作者的文章比較牛嗎？
發表論文時對論文作者署名必不可少。有的研究還可能會出現不止一名作者的情況，即聯名發表。因此如何在聯名發表的論文中評估每位作者的貢獻成為越來越重要的議題。一般文理商法等人文學和社會科學的出版刊物中，以單一作者的名義發表的論文相當常見，但有一些研究可能需要多位論文作者一起協同研究，這時就有必要以共同作者或多重作者的名義發表論文。在理工和醫學等學科的出版刊物中，聯名發表則相當普遍。這與學科研究的方式有絕對關係。論文是否為聯名發表、有多少作者，能作為衡量論文價值的指標之一嗎？。 根據Robert Woods的研究，在90年代末期，有72％的旅遊管理學界學者認為，單一作者的論文所能獲得的點數應該要大於有共同作者的論文，而有共同作者論文的點數則應該大於多重作者論文的點數。Woods將八種旅遊管理學期刊的6,691篇論文做了量化分析，發現了這一趨勢：1989年起，一篇論文平均擁有1.5位作者，但到了2008年，一篇論文的平均作者數量已經達到2.3位。這意味著旅遊管理學界對於單一作者論文的看法，與學界實際操作有一定落差。而當這個差距正在加大時，單一作者論文具有的價值也會動搖。 在此，核心問題是如何評價多重論文作者名義發表的論文。一些研究是必然會牽涉到非常多學者參與和貢獻的。最極端的例子，是頂級期刊《自然》上頭的一篇由五千名作者聯名發表的物理學論文；另一個例子，是做果蠅的基因序列：該論文總共有1014名作者，其中900人左右是大學本科生。 那如何確定列名的論文作者都足以列名的貢獻呢？ICMJE建議，素：1）對於研究工作的設想、設計、取得、分析、資料闡釋有顯著貢獻者；2）起草論文，或對於重要知識面內容提出關鍵修改者；3）確定論文最終版本者；4）同意為論文內容的正確性和規範性背書者。若不符合這四個要素，但仍對於研究有一定貢獻者，ICMJE建議將這類人士列為貢獻者而非作者，如此才能將參與研究工作的研究者做出不同程度的貢獻進行區分。 但是，將所有參與者都列為作者是某些學科的傳統。關於發現Higgs boson的論文就列了兩千多位作者，而其中的一位作者受訪時表示，物理學界長期以來都接受這種列名方式，而且學界內的人都知道如何解讀每個人的具體貢獻。更重要的是，將全部作者列名的論文，在這種學科傳統中反而顯得更為正當，不只是因為這種傳統才能反映出大型計畫的研究工作所需要使用到的人力為何。物理學、基因學等的大型重要研究，靠得就是組織大量的大學生、研究生、博士後等研究力量，才能夠真正發現重要的結果。當這些年輕的一輩被列名了、有了參與大型計畫的記錄了，對於往後大型計畫尋找人才也有很重要的指標性意義。 簡單來說，列名論文作者的多少與一篇文章的引用數量並不存在直接關係，但當一篇論文列名五千人，且期刊接受刊登時，這代表的不只是期刊要為這五千人提供點數，而是這個龐大研究工作得到了指標性結果。這種論文自然會是高引論文。從這個面向來看，糾結于多少名作者比較能夠受到期刊青睞，更多是屬於投機取巧的技術性問題。但是，一篇論文的研究結果若不太顯著，一些期刊或許會出於學界傳統，而考慮這個結果是一次合眾努力所獲得的，或許會有發表的價值。
6 years ago
使用「研究實驗室工具包」加強科學研究
新冠肺炎（COVID-19）的暴發在科學生態系統中引起了一場無法預料的劇變，導致研究實驗室中傳統的科學出版和工作流程發生了巨大變化。許多國家的研究人員正在努力恢復研究活動，隨著社交距離增加帶來更多的影響，研究人員越來越關注如何保持競爭力和研究工作效率，因此他們迫切需要重新考慮科學研究和實驗室管理的各個方面。 我們的專家為全球研究人員準備了一個研究實驗室工具包，幫助他們重新開放實驗室，並從這個史無前例的社會活動中斷狀態下逐步恢復研究。該工具包將幫助研究人員主動規劃、順利過渡並且回歸實驗室。工具包中的清單將説明研究人員起草適當的研究計畫，並採取措施緩解由於新冠肺炎流行所產生的負面影響。 實驗室是否配備了可以在疫情流行期間能保持正常工作的設備？ 研究人員和學者都渴望回到他們的實驗室！一些實驗室正在考慮採用錯峰的工作時間表分階段地重新開放。當然，在這個過程中非常重要的是實驗室必須配備齊全並充分遵守安全指南。 首先是確定實驗和實驗室系統的優先順序，那些關鍵的實驗將會給予較高的優先順序。主管和高級實驗室成員必須仔細評估科研活動，確定哪些在家中也能夠被有效執行。制定並遵守社交距離規範，讓其他必須在實驗室工作的成員能更有效地利用空間。此外，主要研究人員在制定工作時間表時，必須考慮在實驗室長時間工作後可能出現的壓力和焦慮感。在這個充滿不確定的時期，採用靈活的計畫活動來防止因人員減少而造成的延誤也非常重要。此外，實驗室管理人員還可以考慮重新分配職責和對實驗室成員進行交叉培訓，以便在需要的時候他們也可以介入並且提供支持。此外，封城和旅行限制已經嚴重影響了供應鏈系統，因此明智的做法是對試劑、消耗品（包括消毒劑和個人防護設備）和數量有限的實驗室用具進行規劃使用。 研究人員在制定實驗重新開放協議的時候應該注意規定的可逆性，以應對出現意外或者在緊急情況下導致實驗室功能再次縮減。 我們專家起草的這份清單涵蓋了主要關鍵點，這些關鍵點將指導實驗室管理人員準備研究工作區，並為緊急情況做充分的準備。 疫情期間研究人員的專屬注意事項 新冠肺炎病毒具有高度傳染性，因此研究實驗室的安全和工作人員的防護是重中之重。每個實驗室成員都必須採取額外的預防措施，以最大程度地減少傳播感染和表面污染的風險。在進入實驗室之前，研究人員必須進行適當的新冠肺炎病毒風險自我評估，以確保同事的人身安全。 研究實驗室的管理人員必須制定一個適當的時間表來管理共用的研究設備（比如組織培養室、發酵室和顯微鏡室等），並對其進行日常消毒。根據研究性質的不同，在必要的時候使用適當的個人防護設備（PPE）非常重要。此外在使用設備的前後都必須進行徹底清潔，尤其是高接觸表面。實施工作夥伴安全系統，這樣每個在研究機構工作的研究人員都擁有一個工作夥伴（同事），他們可以在每天的開始和結束時簽到，這可以鼓勵研究人員就疫情流行期間可能面臨的問題進行公開對話。 查看此清單，其中列出了研究人員在恢復研究之前必須遵循的所有關鍵預防措施。 在疫情流行期間開展研究工作的提示 研究人員在努力保護自己的同時還在從事涉及人類參與者和動物受試者的實驗工作。一般來說，針對動物和微生物的研究的理想持續時間從數周到數月，甚至達到數年時間，因此研究人員會擔心研究因疫情的關心再次中斷或推遲。 研究人員在保持勤勉的同時需要變得更加有條理和有規劃，現在需要重新評估實驗室的安全政策並更新實驗室操作規範，以更好地應對新型冠狀病毒。此外，實驗室負責人必須確保在實驗開始之前，能夠有充足可用的關鍵耗材，包括哪些保質期短或需要從國外採購的耗材。與此同時，需要確保計畫的研究符合所有安全要求，其中包括機構審查委員會（IRB）和機構動物護理和使用委員會（IACUC）等的批准。我們的專家起草了一份準備清單，概括了哪些制定有效的研究連續性計畫應採取的措施。 下載清單，確保您輕鬆開展研究。…
6 years ago
Writing Better Is Now Easier Than Ever: Edit With Trinka AI
We are hosting a series of webinars to demonstrate how Trinka AI ill assist authors..
6 years ago
論文處理費，多少才合理？
學術作者發表論文不但沒稿費，可能還會被期刊收取「論文處理費」（論文處理費隨著開放近用期刊的發展而起，不采訂閱制的期刊，為了平衡出版成本，而向論文作者收費。在8760種開放近用期刊中，有約27%的期刊會向作者收取高昂的論文處理費。以著名的開放近用期刊Nature Communication所收取的論文處理費為例，作者需要支付3790英鎊／5380美金／4380歐元，且這還不包括營業稅或其他地方稅。 在若干情況之下，論文處理費是可能減免的，例如一些作者所在的國家若是經世界銀行認定的低收入地區，那作者提出要求後，期刊編輯會斟酌提供論文處理費的豁免或減免權利。Biomed Central （BMC）則表明，一些機構或科研單位可以加入會員機制，能夠獲得論文處理費減免或折價的優惠，而若發表者的機構無法加入會員，且發表者無法承擔論文處理費，那麼可以協商豁免。 論文處理費如何定價？費用包含哪些服務專案？根據多學科數位出版機構（Multidisciplinary Digital Publishing Institute）所公佈的論文處理費收費標準可知，此機構下的開放近用期刊論文發表所需要考慮的成本，包括了初步篩選、組織同儕評審、編輯製作、校稿、其他編修服務、期刊管理和客戶開發、編目和檔案維護、長期儲存等專案。除了考量這些支出成本之外，並綜合對不同作者的豁免和減免考量，才能訂出一個比較公允的價格。也因此，也有一些出版機構會為旗下的不同期刊定出不同的論文處理費，例如Hindawi的開放近用期刊收費標準就從最低650美金到2400美金不等。 以MDPI的例子來看高額收費的合理與否。附屬於這個出版機構下的期刊總數達到272種、且其中有76種收入SCIE以及Web of Science等廣為學術界接受的檢索平台，所以在MDPI旗下期刊發表論文的誘因相對較高。另外，根據一些網路分享經驗，投稿到MDPI下的期刊後，審稿品質和處理速度是可以接受的，一審十五天結果出爐，且意見都相當到位，並且在歷經反復修改再投之後，五天左右的時間就可以獲得新的第二審意見，並在第三輪修改後，編輯就同意刊登了。在這種考量之下，若作者的經費充足，且對發表論文的時程和數量有需求，那麼MDPI確實提供了相當有利的審稿與修稿環境，其高額收費也不是不能理解。但是，從這種模式看，MDPI系列期刊審稿的主要考量，是要讓作者的論文達到能夠發表的底線為原則，不見得是提供最好的論文和最優質的發表環境。就現在的環境來說，研究者可以綜合考量研究經費可以負擔的論文處理費上限、期刊所提供的服務品質與收費之間是否公平、期刊本身的品質和等級，來選擇投稿的物件。 歸根究底來說，開放近用期刊的收費就是換取論文流通的代價。若期刊選擇不採取訂閱制，希望讓發表論文的環境趨近於無障礙流通的情況，那期刊就必須要尋找支持自己營運的財源。雖然為數眾多的開放近用期刊是不收論文處理費的，但是近年來論文處理費漲幅達到百分之六，且一些傳統的訂閱制的出版機構，如牛津大學出版社，為了適應全球圖書館預算經費縮減，也開始採取訂閱／開放近用的混和制，一方面響應學術界要求，減少付費牆對學術研究和知識的阻礙，另一方面則是要和收費的開放近用期刊搶食這個不斷擴張中的大餅，瞄準的是研究計畫的預算經費。 一些傳統上有充足經費支持的頂級期刊近年來也開始收取論文處理費了。著名的eLife期刊開始收取2500美金的論文處理費，這是個相當大的轉變。有趣的是，若用eLife刊登一篇論文的成本來計算的話，應該要收取6000美金，2500美金比較像是反應業界標準，而非反應頂級水準期刊需要承擔的成本。也就是說，eLife的收費其實混淆了論文處理費和期刊水準之間的關聯性。如果靠論文處理費支撐的開放近用期刊是未來趨勢，那作者需要負擔什麼樣子的金額，才能讓期刊和刊物內容達到高水準，就是未來學界與業界必須要更加仔細評估的問題。
6 years ago
後疫情時代的藥物警戒：機會與挑戰
根據世界衛生組織（WHO）的定義，藥物警戒（Pharmacovigilance）是指為「偵測、評估、瞭解以及預防藥物不良反應以及任何其他與藥物有關問題的活動及科學。」藥物警戒是 WHO 在 1961年Thalidomide (沙利竇邁) 造成大量畸形嬰兒的悲劇後推動產生，旨在提升病人安全及照護，並提供公共衛生系統平衡、可靠的資訊，從而更完善地評估藥物風險與益處。 新冠病毒疫情下藥物警戒的調整 臨床試驗執行：由於新冠病毒疫情造成的旅行限制、人員隔離、醫學研究中斷、醫療人員感染等問題，英國 (MHRA)、歐洲 (EMA)、法國 (ANSM) 和美國食品藥品監督管理局(FDA) 已對臨床試驗的藥物警戒提出新的指導方針，如必須優先呈報未預期嚴重藥品不良反應 (SUSARs)，無法與病人面對面問診時應採用電話聯絡，並且增加其他藥物警戒報告的時間彈性。 臨床試驗稽核：歐洲…
6 years ago
文獻管理軟體在論文寫作上的使用秘訣
當研究人員與學術作者將研究成果匯總發表進行論文寫作時，往往會在整理大量參考文獻時花費許多時間與精力，這時候就需要借助文獻管理軟體達到省時省力的目的，從而讓自己專注在內容寫作上。文獻管理可以簡化整理文獻的流程，讓作者可以直接插入各種來源的參考資料，方便排序與參考，並按照作者或期刊需要修改為各種格式，也可以在類似主題的文章內插入相同的參考文獻。只要在電腦上操作文獻管理軟體，連接到數位圖書館上，就可以輕鬆插入引用論文並自動創建參考書目。 文獻管理軟體在論文寫作中的作用 文獻管理軟體可以為作者在寫作論文時帶來極大的便利性與優勢，其主要功能包括： 插入引用論文，完整整理出該文獻出版日期、作者、目次等資訊。 創建清楚詳細的書目，可以在文章完成後一口氣處理。 可以依照各期刊調整為需要的引用格式。 從資料庫中自動搜索最新資訊，可以利用DOI、ISBN、PMID等標籤碼進行搜尋。 透過連接當地圖書館，直接下載該引用論文的本文。 各種常用的文獻管理軟體 不同的軟體有各自的強項，有的操作流程很簡單，有的可以讓作者更快速地創建書目，還有的可以共用自己的搜索文獻來進行協作處理。這邊介紹幾款深受研究人員推崇且好用的軟體： EndNoteTM：第一個開發出來的文獻管理軟體，持續有更新版本推出，必須付費才能使用。 Mendeley：於2008年在倫敦推出，已儲存了超過三千萬筆文獻資料。 Readcube：介面優美強大，且可以接受由其他管理軟體匯入。 Zotero：於十年前推出，此軟體彙集了一般學術論文與媒體文章和聲音影像。 Citavi：來自德國的軟體，利用其內建資料庫可以進行多種不同類型的文獻引用。…
6 years ago