Navigate

發表研究

人工智慧時代讓AI來做研究助理

十年前，不少人還對AI短期間內在學術研究這項高度智能活動能否有助益抱持懷疑態度。近年來全世界的學術出版量都在成長，中國國家自然科學基金委員會（NSCF）近五年來每年收到的稿件量都以10%在成長，2019一整年收到的稿件高達22萬， NSCF大膽採用了AI協助審稿。 不僅審稿，AI在論文撰稿的學術寫作環節也能大顯身手；瑞典古騰堡大學的自駕車研究團隊光在自駕車演算法上搜尋就找到一萬筆參考資料，負責教授掐指一算，發現要好幾年才能讀完，於是求助於會分類文章的Iris.AI，就解決了這個棘手的問題。除了文章分類大師Iris，AI學術寫作文法工具Trinka、COVID-19研究加速工具CLARA、還有獎助諮詢專家Dimensions、AI智者Semantic Scholar、實驗數據專家SourceData等都是相當有潛力的AI助理。 其中，。學術論文的文法和用語要求遠比普通寫作更複雜，Trinka能偵測超過三千個複雜文法錯誤，而且還能建議學術寫作的文風及用詞。CLARA是一款由人工智慧驅動的免費的冠狀病毒研究和臨床試驗發現工具，全稱是COVID-19 Learning and Research Accelerator（COVID-19學習和研究加速工具），使用人工智慧從42,000+份研究論文和2289+份COVID-19臨床試驗中查找最相關的最新COVID-19研究和試驗資料。 Iris.AI則是文理通吃，能利用300-500字的摘要或是網路上可存取的URL將研究的參考資料依據小主題組織成圖像式分類地圖，能搜尋一億三千四百萬筆線上開放論文和圖書館線上公開資料。Iris能使用3種演算法，會將文章的用字頻率列入相關性的指標，比起只要出現在同一個句子中就可能被標記相關的其他AI不一樣。 還有許多AI研究助理正式進入學術這一行，比如Nature期刊大股東Holtzbrinck出版集團底下Digital Science這個科技公司所創的 Dimensions，使用獨特的搜尋語言（Dimensions Search Language），付費版本可以幫助搜尋研究獎助申請、分析獎助及專利資料。，目前已整合了超過四千萬筆資訊科學及生化科學的資料，這個知識庫還在不斷增長，計畫負責人說，終極目標是囊括所有的學術知識。還在發展階段的SourceData，正在技術人員的訓練下學習製造兩萬筆實驗資料的知識圖，相信它未來的能力不可限量。…

6 years ago

預印論文加速出版，小心5種病毒感染機制！

新冠病毒與人類世界的戰爭還僵持不下，不僅如WHO所說，人類已無法回到新冠病毒流行前的秩序，連學術界也正承受新冠病毒帶來的許多衝擊，自從COVID-19大流行以來，醫學研究出版界為了早日在理論層面提出解決之道，努力說服收費訂閱期刊將新冠病毒的醫學研究免費供閱，以加快資訊分享的速度。 但是近來醫學研究出現亂象，許多研究人員選擇在出版速度較快但實質學術影響力較低的預印論文平台上發表論文，缺乏充分審查機制的背景下，年初竟出現預印論文推論新冠肺炎病毒可能來自實驗室這樣的言論，雖然文章已因為可能違反科學倫理及發表規範遭撤下，但我們不禁要問，醫學研究的發表速度難道比正確性重要嗎？ 學界暫時還是肯定預印論文在快度傳播研究成果上的貢獻。至5月初的時候英文的新冠病毒肺炎醫學研究發表論文已經到達每週4000篇的速度，讓1月至5月初新冠病毒期刊論文發表總量到達23000篇，並朝著每20天增加一倍的速度增長。沒有任何研究人員能夠消化如此巨量的資訊，因此一些具指標性的學術單位正在嘗試為醫學研究人員有效篩選所需資訊，比如Johns Hopkins University 的彭博公衛學院就在建置經篩選過的新冠病毒論文資料庫。 其實，2020年初起，學界就嘗試建構一個大型新冠病毒醫學研究資訊寶庫，3月16日由於白宮科學與技術政策辦公室的主導下飛速進展，一個月後已經成為典藏59000筆醫學研究資料的大型資料庫，Google、Chan Zuckerberg Initiative等大型機構都投入人工智慧技術企圖發展出有效的搜尋系統；然而4月17日一篇預印論文指出，這個資料庫中60%的文章沒有使用coronavirus 或SARS-CoV-2等關鍵字，有4萬篇左右的文章並沒有提供全文，也就是無法達到資料探勘（Data Mining）的效果，可見在新冠病毒這個全新的題目上數大並非美。 如果想維持醫學研究論文的品質，千萬不要為了貪快而犯了下列違反發表規範的五種錯誤： （1）樣本數過小（Small Samples）：在短時間內無法採到具代表性的樣本數，就先以小樣本群的結果發表，最後醫學研究實驗結果其實不具代表性，參考價值低。 （2）多重比較（Multiple…

6 years ago

新冠病毒竟然是學術圈性別差異的照妖鏡

我還在博士班的時候，與目前是研究人員，當時也在博士班的外子論及婚嫁時，就開始處理雙學術工作家庭的性別差異問題，所幸外子和我在家庭工作分配上都能夠完全分工合作，在孩子上幼兒園之後我們的家庭運作漸入佳境，但是我的女性同事和朋友未必這麼幸運，有人選擇不生小孩，有人則是為了孩子犧牲工作。 新冠病毒全球大流行以來，台灣幾乎沒有因為新冠病毒造成的停班停課，但是今年自三月開始全球性的停班停課或是在家上班及線上教學這股社會隔離（social distancing）的發展態勢直到6月初的現在才出現些許轉圜，而以美國為首的許多國家都已宣布本學期只有線上課程，甚至考慮2020年秋季也只有線上教學。在家工作不難，但是對家中有學齡兒童或更小的孩子的年輕父母親來說，孩子只能與自己一起待在家裡就是最可怕的夢魘，歷經這場惡夢的父母有許多都是學術研究人員，而女性研究人員在社會隔離的背景下可說正面臨著嚴重的性別差異。 自然期刊新聞網（News, Nature.com）5月20日的報導中說道，目前已有兩份最新研究資料談論社會隔離背景下學術工作者在出版量上呈現的性別差異現象，女性研究人員似乎有較高的家庭工作及育兒負擔，不僅2020年3月至4月在科學領域的預印本文章發表量有所消減，此時期的發表成長率低於男性研究員同時期的發表成長率，與2019年同時期的發表量比起來也有少無多。 其實，學術圈的性別差異一直都存在，相關研究指出，從事學術研究的女性在結婚及成為母親之後常無法平衡職業與家庭的比重，因此而需要轉成兼職甚至離職的女性學術工作者不在少數。許多國家或許有育嬰假的立法，但是個別機構或公司育嬰假的落實其實常因個案而異。女性也認同生理及社會所賦予的性別角色，往往主動承擔較多的育兒責任，在就業環境沒有其他支援的情況下，無法投入時間精力的育兒期女性研究人員平均發表數較少，獎助機會業較少，形成彷彿「當媽媽的懲罰（Penalty for Motherhood）」這樣的實質效果。 講性別差異不能不提美國現任大法官Ruth Bader Ginsburg，看過這個追求平權的劃時代行動就知道，改善學術圈的性別差異只能從我們自己做起。本文想提出兩個具體的作法： 其實婚後會面臨的性別差異的源頭就在家裡。女性研究人員如果感到性別差異造成的壓力，應該先與另一半詳談，冷靜分析家庭工作的分工，及如何合作育兒，雙方願意付出的時間和精力的底線在哪裡，備用方案為何，並給予半年到一年的耐心，形成能正向循環的家庭生活方案。 女性學術研究人員，尤其是自然學科專業，可以組成以研究領域或機構為單位的學術社群，可以參考Women in Science…

6 years ago

預印本如何幫助研究人員在疫情肆虐下找出研究發表的生路

新冠肺炎大流行造成全球各學校和研究機構關閉實驗室，研究工作停擺，各國政府只允許該國最關鍵的研究和新冠肺炎相關研究繼續進行。在這一片迷霧中如何確保研究成果不會被耗時的同儕審查延誤，或是被各期刊出版社的保守出版流程限縮了研究成果的傳播範圍？一種從1990年代開始在物理學界使用且接受度越來越高的發表模式開始在生物學界被採用，2017年也獲得FaceBook創辦人和妻子的基金會Chan Zuckerberg Initiative贊助，在這次的疫情風暴中預印本展現了至關重要的功能。 預印本機制扮演的關鍵角色 大流行期間政府有關單位必須仰賴科學界與醫療界對COVID-19的最新研究才能做出最迅速正確的反應，因此讓正確的研究結果快速地被發表出來是科研界努力的目標和責任。在首位確診病例後的4個月內，全球一共發表了16,000篇以上與新冠肺炎相關的學術論文，其中至少有6,000篇是由預印本伺服器託管。在伺服器上發表的預印本為開放近用，可以被所有人閱讀且評論，是減少了同儕審查的時間，但同時也因為快速發表的緣故而難免出現數據不可靠的論文。 如何在疫情之中傳播正確資訊並攔截不實研究 各領域的預印本伺服器都有各自的論文審查機制。例如生物方面的bioRxiv會與生物學家合作，medRxiv則會與醫療衛生專業人員合作，如此一來可以從專業的角度剖析研究的可信度。這兩個伺服器都擁有兩層檢視過程，第一關由內部人員檢查是否有剽竊和內容不完整等問題。然後再由學者專家檢查文章手稿，檢視科學內容以及健康或生物安全風險。在bioRxiv上通常耗費48小時，而medRxiv因為與健康有直接相關，因此處理時間通常為4到5天。 在封鎖隔離期間帶來的優勢 預印本的公開審查且不帶有利益色彩的評鑑過程，著實影響了傳統出版社的觀念與做法。另一方面也加速了學術論文審查發表的過程，報導指出疫情期間與COVID-19相關的學術論文其上傳到研究發表的時間從平均117天銳減為60天。許多雜誌也將研究結果設定為可開放近用存取，消弭傳統出版社豎立的付費牆。再加上預印本的網路發表不需要收取傳統期刊高昂的文章處理費，更有利於讓更多人看到，不僅有利於研究發表的資訊傳播，也讓研究人員能更快獲取回饋意見。 如何發表一份成功的預印本 科學與醫療的進步很大部分取決於能否將研究結果有效地在學術社群及科學界傳播，進而讓研究發現得到評估和應用發展的機會。好的預印本發行機制可以讓科學發展更事半功倍，以下簡單列舉幾點注意事項： 將預印本上傳至有公信力且專業的伺服器 鎖定研究的目標讀者，選擇特定領域的伺服器上傳 確定所有論文共同作者都同意以預印本模式發表文章 利用社群媒體宣傳預印本…

6 years ago

10個常犯的期刊投稿合規性錯誤

發表研究成果是研究人員學術生涯的重要成就之一。學術期刊每天都會收到大量的投稿，然而只有一部分能夠順利得到發表，這也意味著每個研究人員在職業生涯中都會有被期刊拒稿的經歷。很多時候稿件被拒並不是因為研究成果不夠好，而是因為手稿不符合目標期刊的要求。這篇文章中，我們將分享十種作者常犯的導致期刊拒稿的投稿合規性錯誤： 1、未能遵守期刊指南：這種情況主要是是因為作者在起草稿件時沒有檢查期刊指南，因此也就沒有遵守相應的期刊要求。 2、資料不一致：稿件中的資料中有不一致之處，或者是資料的無意義重複。比較常見的是文章正文的數字與表格／圖表中的數字不匹配。這些與資料有關的不一致導致稿件無法正確表述研究成果而不符合期刊的要求，因此被期刊拒稿。 3、語法、標點符號和寫作風格錯誤：包括作者經常忽略的語法錯誤，同時標點符號錯誤和風格不一致在手稿中也很常見。如果這些錯誤比較明顯且數量較多，期刊就可能據此拒稿。研究人員可以利用專業的編輯和校對服務來避免這類機械性錯誤。 4、一稿多投：重複出版違背出版道德。作者不能同時向兩種期刊提交同一份稿件，包括稿件的部分內容。許多作者並沒有意識到這一點，認為一旦其中一份稿件被錄用撤回另一份就可以規避問題。 5、缺乏對全面的文獻回顧：文章的導言部分需要對相關研究進行回顧。因此需要在文獻調查時通讀參考相關研究的各個方面，以突出自己研究的新穎性。否則可能導致研究主題重複，找不到創新點而被拒稿。 6、與臨床研究參與者的利益衝突：在臨床研究的情況下，研究參與者的身份通常保密。然而在某些情況下，比如病例報告附有的照片或文字，可能會向讀者透露研究參與者的身份。一旦期刊發現這種違反學術道德的做法，相關稿件往往會被拒稿。 7、參考文獻不一致：手稿中存在參考文獻缺失、與正文不符的參考文獻、以及參考文獻格式不正確等現象。參考文獻的缺失和不準確都會影響論文的可信度。 8、手稿結論部分過於冗長且表述不正確：論文的結論部分必須簡短，並與結果和討論部分的文本和資料保持一致。如果結論冗長又沒有好好承接正文，期刊會要求修改稿件。 9、註腳不清楚：有些細節可能對作者而言是顯而易見的，例如表格中的資料值是經過四捨五入的，但是讀者可不見得知道。因此應在註腳中進行解釋和加以說明，否則可能會因為資料不清楚而導致拒稿。 10、投稿文件不完整：投稿的過程中，除了一份寫得很好的稿件外，還需要提交其他一些相關文件，包括有關作者身份、利益衝突、道德委員會批准等的表格。這個步驟往往很繁瑣，因此常出現投件的表格填寫不正確或不完整的情況。這就造成期刊編輯和作者之間不必要的反覆溝通，從而延遲了出版進程，在某些情況下甚至導致拒稿。 我們希望以上列出的作者常犯的期刊投稿合規性錯誤能對您有所説明，避免稿件中出現類似錯誤。如果您需要深入瞭解期刊提交過程的所有步驟，我們將提供由英論閣專家專門編寫的研究指南，以幫助您順利投稿。祝您成功發表！

6 years ago

COVID-19危機中，如何預防感染不實資訊大流行？

新冠肺炎（COVID-19）確診與死亡人數仍然在全世界持續攀升，尚未看到緩和的跡象。如此大流行的局面讓各國不禁反思究竟做錯了什麼？為何如此禁不起病毒的入侵？追根究柢發現因為初期無法確實掌握武漢肺炎資訊、中後期大流行的真假資訊流竄造成人民對不實資訊信以為真，以上都加深政府在面對COVID-19危機時防疫動作難以落實且醫療資源無法負荷的困難。 不實資訊造成的恐慌超過疾病本身 “Pandemic”一詞是用在流感或肺炎等高傳染性疾病的大流行，而現在它被賦予新的意義──不實資訊的流行。不真實的資訊殺傷力道比沒有訊息更大。世界各國因不精確的資訊而誤判武漢肺炎病毒的傳染力導致醫療系統瀕臨崩潰。政府如果根據不實資訊造成採取不適當的對應措施，會降低人民對政府的信任感。社會上錯誤的防疫觀念、物資缺乏的假消息和未經求證的網路傳言，都會造成COVID-19防疫上的漏洞與資源的浪費，以及人民許多的不必要恐慌。 公開資訊中心所扮演的關鍵角色 武漢肺炎的不實資訊從2019年底開始如野火般延燒到全世界，由華盛頓大學的五位研究人員才剛創辦的公開資訊中心（Center for an Informed Public）面臨了前所未有的挑戰。成員包含了社會學家和危機信息研究人員，致力於研究訊息與統計數據在危機時的傳播情況、社會接受訊息時的反應，以及民眾的反應。除了進行社會科學、資訊科學與法律上的研究，也向社會大眾分享COVID-19的正確知識跟觀念，並透過持續和政府合作建立正確資訊網路，希望透過梳理不實資訊的脈絡以制止其傳播。 如何有效遏止錯誤資訊？ 有鑑於關於新冠肺炎錯誤或不實資訊的氾濫，公開資訊中心的危機信息學家Kate Starbird提出幾點建議： 社會大眾必須對接觸到的資訊更小心地求證。如果無法得知真偽，那就不要散布這則資訊，減少不確定的資訊傳播對抑制恐慌蔓延很有幫助。 專業人員如醫療從業人員或流行病學家，持續和專業社群討論後，分享真實的資訊。同時不要隱藏訊息中的不確定因素，讓大眾清楚了解對情勢的解讀判斷會隨著新證據的出現而改變。 政府應隨時檢討不實訊息帶來的傷害，不間斷地與值得信賴的專業人員和媒體合作，讓決策過程公開透明以博得民眾的信任。…

6 years ago

大學應加入Plan S，停止出版商的箝制！

歐盟11個國家在2018年聯合簽署了Plan S。這項協議是在甚麼樣的背景產生、意義為何，將會帶來甚麼影響？ 研究生或學者可能都有相同經驗：好不容易找到了一篇對自己的研究非常重要的論文，但學校圖書館卻沒有訂閱這份刊物，因而無法閱讀這篇關鍵文章。 出版商把持知識的流通 造成研究者取得學術論文的最大障礙，在於各大學圖書館遭受學術出版商高價箝制，不僅訂價過高，並強制圖書館不能單獨訂閱特定期刊，必須依照出版商組合的套餐期刊照單全收。 大學開始退訂出版商的套餐期刊 面對出版商長期的壓榨，近年來從歐洲到美國，都有越來越多的大學圖書館，退訂學術出版集團強行搭售的期刊套餐。舉例來說，佛羅里達州立大學去年宣布，自2019年起，不再與Elsevier學術出版集團續約，原因便是Elsevier的指定套餐訂價昂貴，且價格不斷逐年上漲，佛州大學決定退出這種不合理的合約，轉而根據校內研究者的實際需求，分別訂閱最恰當的特定刊物。 另外，挪威高等教育暨研究聯合機構（簡稱UNIT），今年三月與Elsevier談判破裂，雖然Elsevier同意為挪威的研究機構降低部分售價，但UNIT認為，出版商對於提倡免費使用學術出版品的努力仍遠遠不足，與挪威立意推動的政策不符，因此UNIT所屬的各大學及研究單位，自2019年與Elsevier的合約到期之後，將不再續約。 什麼是Plan S? 自由的資訊傳播是學術研究的基石，如此科學家才能站在前人的肩膀上不斷創新，為人類共同面對的問題找出更有效的解決之道。 為了達到上述理想，11個歐盟國家於2018年聯合簽署了Plan S，從2020年起，簽署國公費撥款支持的研究，都必須發表在開放近用期刊或出版平台，以便讓更多人能夠無償接觸到研究的出版成果。在Plan S的壓力之下，學術出版商必將重新調整運作模式。 中國知網的壟斷爭議…

7 years ago

Plan S大步邁向學術論文全面開放，轉化性協議大受討論

近年來，如何打破付費牆（paywall），讓由公費支援的學術成果不受阻礙地傳播，已成為科學界熱門話題。許多團體應運而生，歐盟多國發起cOAlition S，致力於推行開放近用普遍化，在2018年底提出Plan S倡議（S計劃），向此目標大步邁進。而為了達成此目標，各大學術出版社必須重新訂定與學術界的協議，一步步取消訂閱收費的模式。 Plan S 簡而言之，Plan S要求於2020年1月開始，由其成員提供經費支持的所有研究，都必須發表於合其10項準則的開放近取平台。 cOAlition S目前包含15個國家機構及4個基金會，參與國家機構已不僅止於歐盟：奧地利、芬蘭、法國、愛爾蘭、義大利、盧森堡、荷蘭、挪威、波蘭、斯洛維尼亞、瑞典、英國、贊比亞、約旦；基金會則包括英國的Wellcome、美國的蓋茨基金會（Bill & Melinda Gates Foundation）、瑞典的Riksbankens Jubileumsfond、義大利的Compagnia di…

7 years ago

理工科目（STEM）性別平等攻略

學術圈中日益重視作者權的道德問題，例如一篇文章多位作者列名，研究顯示， 33%的人坦承曾將對該文毫無貢獻的學者列進共同作者名單中；另一個備受關注的問題，則是女性作者們所遭受的不平等待遇。 學術界的性別不平等 雖然學術圈的兩性平權情況已不斷改善，但在職位、出版、同儕評審、以及作者權的肯定上，兩性間的差別待遇仍存在著相當明顯的落差，儘管許多研究已證明，女性在科學、技術、工程、數學（簡稱STEM）等科目上，其實都有更傑出的表現。 性別差異研究透露了什麼？ 有篇題名為“大數據研究：共同作者間的性別不平等”報告，研究蒐集了從1995至2017年間，有兩位以上同時列名第一作者的科學論文，共2898篇，分析結果揭露了以下幾個重要觀察： 男-女混合的作者組合最普遍，其次是男-男組合，第三才是女-女組合 在男-女混合的作者組合中，男作者為先的比例很高 當作者人數多於兩位以上時，男作者為先的比例高於女作者，而且純粹以男作者為團隊的情況，在很大程度上多於純粹都是女作者的團隊 作者名單中的頭一位，男性作者所佔的比例特別高 上述的作者性別差異現象，導致了在聲望、財務贊助、職涯發展、學術地位等方面，都會相應出現不公平的表現 克服性別差異 所幸，性別不平等的問題已獲得廣泛認知，學界也採取了諸多防範措施，包括： 著重吸引女性研讀科學專業 針對研讀科學的女性籌組學術團隊…

7 years ago

如何有效地搜索和閱讀專利 – 給研究人員的提示

專利有兩個目的：授予發明人權利和防止他人主張所有權。在研究上專利能鼓勵創新，避免在非原創工作上浪費寶貴的時間和資源。如果研究人員計劃申請專利，就一定要懂得怎麼做專利檢索。 專利是出了名的複雜。如何進行專利檢索？在這裡，兩位年輕的科學家Matthew和Jennifer討論要如何有效地搜索和閱讀專利。 專利：基礎知識 Matthew：主管希望我為正在開發的新產品申請專利。不知道從哪裡開始，可以幫幫我嗎? Jennifer：首先，確保你符合專利要求。例如，在美國，要申請的概念不能僅是理論，而必須在現實世界中有實用價值。這被稱為「付諸實際」（Reduction to practice），是研究開發中， 實際創造實體發明或執行過程的一步。此外，發明必須是原創的。 專利類型： Matthew：我們的發明符合這些標準。但是，是否有不同的專利類型？ Jennifer：對，大多數發明都被註冊為發明專利，涵蓋了新產品或改進現有產品；還有設計專利，涵蓋了產品的裝飾設計；植物專利保護新型植物。 Matthew：我肯定需要發明專利。我應該直接去申請嗎？ Jennifer：別急！實用專利有五種類型。第一種是產生結果的過程或方法。第二種是機器，例如，新的醫療掃描儀。第三種是零組件（最終產品的組件，如新型計算機芯片）。第四種是物質組合物，例如新化合物。最後，第五種是對前四項中的任何一項的改進。 Matthew：明白了。我想我需要考慮第一種類型 -…

7 years ago