產業新聞

Clarivate Analytics與中國科學院共同發表《2017研究前沿》

科睿唯安(Clarivate Analytics)與中國科學院(Chinese Academy of Sciences)於2017年11月2日在中國科學院共同聯合發表了《2017研究前沿(Research Fronts 2017)》,連續第4年揭示全球熱門和新興研究前沿。 這份報告列舉了全球科學研究中最重要的100個科學熱點前沿,以及新興的43個新興領域前沿,總計横跨了10個自然科學和社會科學的領域。 所分析的資料匯集了從2011年到2016年為止近六年的基本科學指標Essential Science Indicators(ESI)資料庫,而這個資料庫是來自線上資料庫Web of Science 中的「SCIE」和「SSCI」子資料庫內容為基礎,透過計算其引用次數,篩選出各領域的翹楚。 引述Clarivate…

Seek & Blastn:在癌症研究論文中檢測出基因序列中的錯誤

2017年10月初,科學家Jennifer Byrne和Cyril Labbé分享了一個軟體程式,可以在已經發表的研究實驗中,檢測出不正確的基因序列。利用這個軟體程式,他們在癌症研究的論文中,發現超過了60篇有實驗缺陷。這兩位科學家是將他們在癌症研究和電腦的專業知識結合起來,開發和導入軟體「Seek & Blastn」。這個軟體程式現在正處於測試階段,可供同儕研究人員作線上測試和改進。下一步將進行商業化,並向出版商和期刊編輯推薦該軟體。 自2015年以來,Byrne便致力於識別人類癌症論文中的錯誤,在5篇論文中檢測出基因功能的錯誤。在審查過程中,發現報告中的核苷酸序列(nucleotide sequences)是不正確的,因此有兩篇論文遭到撤回。後續還有兩篇論文在11月21日亦遭撤回。這些錯誤又出現在其他25篇論文中,也促成Byrne和Labbé正式開發和導入「Seek & Blastn」檢測工具。 對於這套檢測工具的原理,簡而言之,從上傳到軟體的任何給定論文中所選出的核苷酸序列,進行基於事實的測試。從技術來說,軟體程式交叉比對檢查選出的核苷酸序列,這是稱為核苷酸基本局部調整搜索工具(Nucleotide Basic Local Alignment Search tool,BLAST)的公共資料庫。如果描述的目標人類基因序列與Blastn資料庫不匹配,則會標記錯誤。相反的,半自動化軟體程式也可以檢測被描述為非目標的序列,並且與Blastn資料庫匹配。儘管目前僅限於人類序列,但是它們還希望包括其他物種的序列驗證。…

如何搜尋開放近用期刊資源以協助研究工作

近年來,在網路環境成熟的推波助瀾下,開放近用(Open Access,簡稱OA)期刊逐漸得到廣泛而大量的支持。OA期刊得以使世界各地的研究者在無遠弗屆的網路世界接觸並下載、無償使用並與相關社群分享學術研究成果,使得知識得以快速傳播,人們共享文明與智慧結晶的累積並更快速地突破現有的成果與基礎。這也使得OA期刊的傳播更快更廣,並有更高的機會被引用。   OA文章的模式已於近年發展出許多類型: 巨量期刊(megajournal):此類期刊提供了出版文章數量龐大、內容領域廣泛、文章一出刊即為開放近用的出版平台。對於作者來說,僅針對具科學性與否的客觀評議標準(因而此類期刊具有高接受率的特性)、相對來說較短的審議過程,加上較低廉的文章處理費用,是對尤其剛起步的研究者極為友善的發表平台。此類期刊的例子有:PLOS One、BMJ Open及 Scientific Reports 。 延後型(delayed):期刊訂出特定期間的「閉鎖期」(如出版後一年內),此期間的文章仍需付訂閱費;過了閉鎖期後,文章即完全為開放近用。部分這類期刊並提供自我典藏(Self-Archiving)與綠開放近用(green open access)的選項,在此模式下,最後出版版本的文章需付費下載,但作者可將文章複本的出刊前或出刊後版本(視該期刊出版政策),置於個人網站或是所屬研究機構的資源庫。 混合型(hybrid):這類期刊仍以使用者支付訂閱費的模式為主,但也提供作者可經由支付文章處理費而使作品轉為開放近用的選擇。 翻轉型(flipped):原本為訂閱模式、而後轉為OA形式的期刊,這類期刊的例子有:Nucleic Acid Research 、Nature…

霍金博士論文造成網路大癱瘓

有多少人會去網路上為了向一篇博士論文朝聖而造成網路大癱瘓?2017年10月23日,劍橋大學開放民眾免費下載英國物理學家史蒂芬‧霍金(Stephen Hawking)在年輕時所發表的博士論文。此消息一出,引起民眾爭先恐後前往朝聖,宛如紫爆般,造成劍橋大學的網站大當機。主要是由於大量民眾湧入網站下載論文,使劍橋大學的Apollo知識庫出現暫時性的癱瘓。多年來,民眾對這位當今世界上最負盛名的科學家在1966年所發表的博士論文,一直保持濃厚的興趣。在取得霍金教授的許可下,2017年開放近用週的慶祝活動中,提供了理想的平台,助其發布論文。   對於這份長達134頁的論文中,儘管大多數人可能依舊無法參透宇宙膨脹的影響和後果,但對於一位24歲研究生之研究成果感到難以置信。如今這位75歲的物理學家之所以願意投入這項改革活動,主要是因為他受到牛頓(Isaac Newton)、愛因斯坦(Albert Einstein)和馬克士威(James Clerk Maxwell)等前輩的啟發,希望此舉可以鼓勵新代物理學家跟進。   霍金教授希望那些到訪這篇論文的人,因而不再感到灰心喪志,並且更應進一步深信,在世界上任何角落的每一個人,都應該有機會能接觸偉大的研究,並且存有好奇心。目前,這篇論文在大學網路系統中創下最大的下載量,而此之前,欲獲取這篇論文的電子檔案,必須花費65英鎊的價格。因此,劍橋大學希望也鼓勵先前學者能受其拋磚引玉的影響而競相效尤。   霍金在劍橋大學三一學院(Trinity College)大廳所撰寫的博士論文,具有核心價值般的科學影響力;隨後又寫了經典鉅作「時間簡史(A Brief History…

掠奪型研討會數量漸增

許多學者將自身學術生涯押在某些學術出版的掠奪者—掠奪型期刊或研討會上了。這些看起來類似合法學術期刊或研討會的組織,利用學者在學術出版與分享其工作成果的需求而圖利。邀請學者至國際性研討會意謂著其研究成果具有重要性並在相關研究領域具影響力。這也是決定學者晉升或任職時其中一個評估因素。這些研討會往往藉由收取高額註冊費以欺騙與會者。掠奪型研討會目前數量已超過合法研討會。 研究人員可經由觀察下列警訊來分辨是否可能為掠奪型研討會。其一,在單一會議中討論多項主題。例如,你可能會同時聽到農作物輪作、巨觀經濟模型與巴洛克音樂研究主題。這意謂著學者們將與一群對自己的工作成果毫無興趣的人身處一室,而非與一群相關領域人士進行互動。 另一種警訊為研討會組織單位。對於掠奪型研討會組織單位而言,在同一地點舉辦數種不同研討會的情況並不罕見。也可能這組織單位幾乎一年到頭天天都在辦研討會。 這些研討會組織單位在其摘要篩選過程中並不使用同行審查流程。這意謂著摘要的審稿週期很短,可能短至24小時內便被接受。掠奪型研討會組織單位亦可能邀請專業背景迥異的講者。例如,心臟病學家受邀至植物病毒學的研討會。組織單位只熱中於向與會者收費,但對會議內容品質不感興趣。 掠奪型研討會的邀請函往往充斥溢美之辭並以粗糙的英語寫就。例如「某某團體認可您為世界級專家,能對放射線學與影像的最新發展提出深度見解」等語。 掠奪型研討會實況? 有位英國網路安全專家最近才上了一個掠奪型研討會組織單位的當。當他抵達丹麥、第19屆政治心理學國際研討會現場時,方才意識到受騙。這場研討會是由兩天共計三小時的演說組成。他觀察只有不到10人在研討會舉辦的單間會議室,且在會議期間,他聽到了關於機器人、伊斯蘭財務與太陽能等主題。就像是在一個房間裡舉行了多個研討會。 此研討會費用為400英磅,係由世界科學、工程與科技學院(World Academy of Science, Engineering and Technology, Waset)主辦,參考官網該組織光在2018年便辦有183項活動。每項活動實將同時進行約達320場研討會。…

地平線2020下的研究創新計畫

地平線2020(Horizon 2020)為一歐盟的科研創新計畫。此計畫將於2014至2020年間揖注800億歐元以支持科學突破並帶動經濟成長。   歐洲委員會近來宣布其對2018至2020年程序中最後一步的投資計畫,將由地平線2020計畫中提供300億歐元資助關鍵領域的科學研究,例如氣候變遷、移民問題研究、乾淨能源等。地平線2020工作計畫將給予科學家獲得資金的機會。目前的工作計畫涵蓋了17個研究領域。其中有4項重點領域為跨主題研究並與歐盟政策相符:建立低碳、具氣候韌性的未來(LC);連結經濟與環境收益—循環經濟(CE);歐洲工業與服務之數位化與轉型(DT)以及強化歐盟安全效能(SU)。   新研究焦點 地平線2020科研計畫將延續其任務,資助創新與創業。自2018-2020年,此計畫將資助符合歐盟首要政治性考量下更關鍵的研究領域。預計聚焦於:   建立低碳、具氣候韌性的未來(30億歐元) 連結經濟與環境收益– 循環經濟(10億歐元) 歐洲工業、服務的數位化與轉型(17億歐元) 強化歐盟安全效能(10億歐元)以及 移民問題研究(2億歐元)  …

2017年世界科學記者會議

  世界科學記者聯盟(World Federation of Science Journalists)於2017年10月26日至30日在美國舊金山舉辦了世界科學記者會議(World Conference of Science Journalists, WCSJ)。該聯盟有9,000名會員,他們在科學、健康和科技等專業領域中,都各自擁有自己所屬的記者組織。   WCSJ 2017第一次在美國舉辦,是「世界科學記者聯盟」、「全國科技作家協會(National Association…

Elsevier開放近用之爭 – 德國科學家集體辭職以示抗議

曾幾何時,學術出版業竟成了最有利可圖的行業之一?你可知現在國際期刊的訂閱費用是如何令人咋舌?據馬斯克普朗克學會(Max Planck Society)統計,圖書館需為每份期刊論文付出約3800-5000歐元(約為13.5-17.7萬台幣)的費用,訂閱費用更以每年5%的漲幅增加。以學術出版商龍頭Elsevier為例,其於2016年度獲利高達40%,連多數世界知名企業也難以企及。 以Elsevier為首的三大出版商(Elsevier、Wiley與SpringerNature)旗下擁有絕大多數國際間最權威的知名期刊,研究人員為了發表自己的心血結晶,投稿論文時即簽署將版權無償讓渡予出版商,出版商使用免費的研究成果與學術審查人力,再以高昂訂閱費用將期刊電子資料庫售回給各國的大學、圖書館與研究機構,如此重擔使這些學術單位叫苦連天,即使學術文獻收藏預算豐厚的哈佛大學也漸無力負擔。 由德國許多學校、圖書館、科研機構所組成的DEAL聯盟在2016年底展開與Elsevier的協商,但出版商強硬的態度加以提出費用更高的包套訂閱方案,終使新年度的合約談判正式宣告破局。在此同時有5位德國科學家集體自Elsevier請辭,作為這場抗爭的最後手段。DEAL聯盟聲稱這只是個開始,高達200個DEAL成員機構拒絕與Elsevier續約。 DEAL向Elsevier提出的訴求,包括更合理的訂閱價格以及單次付費的全國授權開放近用方案,一種他們稱之為「出版而閱讀(publish and read)」的模式。由於出版商並非出資贊助研究機構的對象,DEAL提議對出版商支付以德國研究機構為首所發表文章一次性的文章處理費,出版後開放給德國全國閱讀使用。但Elsevier認為這個模式不切實際;相較於Elsevier強力捍衛的態度,另外兩大學術出版商Wiley與SpringerNature表現出對「出版而閱讀」模式較和緩的姿態,若最後與這兩大出版社能達成協議,Elsevier勢必得作出讓步。目前整體關鍵點在於,適用於學術與商業之間,如何反映每篇出版文章成本的合理價位。 芬蘭亦組成FinElib聯盟,與Elsevier展開協商,同時聯盟中數百名會員亦發起了No deal,no review抵制行動。芬蘭此舉不啻為一劑強心針,強化了歐洲國家對於向出版商爭取合理價格的動力。此外響應抵制行動的尚有祕魯與台灣。眾人尋求的並非免費的服務,而是更為合理的使用價格。事實上,Elsevier尚承受了一些非法的開放近用平台例如Sci-Hub的壓力,固然不願冒著失去學術出版的領航地位以及占據這塊日益成長市場的風險,若德國與芬蘭帶頭的抗爭成功,世界各地將會有更多學術聯盟紛紛揭竿而起,屆時,或許是學術出版業傳統訂閱模式時代的終結。

預印本:早期出版研究有下降趨勢嗎?

在生物學界,有一場論戰已經引爆,那是關於在期刊上進行正式的同儕審查研究論文前,已經先使用預印本(preprints)在網路上提早分享了。預印本乃是發表在自我歸檔的平台上,如BioRxiv,對所有人都是免費的。預印本的先行者ArXiv,作為早期出版的一種形式,自1990年代以來,一直被物理學家所採用。主要還是由於傳統出版和繁瑣的同儕審查過程,使科學家和金主都感到挫折。而預印本能提供快速的、公開的報告,加速科技進步的腳步,也可以反擊那些所謂的掠奪性出版商和昂貴訂閱費用的傳統刊物。   預印本革命對生物學界的衝擊 生物學界的論戰硝火,不可能在一夕間就灰飛煙滅。生物學界與物理學界不同,將論文作為預印本出版,在物理學界是個常態,而生物學家現在才認真考慮預印本的可行性。因為希望能與同儕和社會大眾作更公平、更公開、更透明的互動,當然也摻雜了競爭的因素。預印本可能會幫助作者的聲稱被及早發現,並可幫助其他讀者儘早閱讀、使用和引用您的結果。還能讓金主看到作者的研究已近乎完成,且出版準備就緒了。   預印本:太好而太不真實了嗎? 對於生物學所面臨的預印本革命,從Wired期刊的一篇文章中,給了一個很好的說法。撇開同儕審查,它可以把線上發布的科學論文潛在的缺點,輕描淡寫很快的帶過去。同儕審查的價值通常不是問題:大多數科學家都希望這麼做,社會大眾也一樣。問題是,在大型訂閱出版社裡,同儕審查的期限受到很大壓力。當然啦,任何新的創新都涉及到風險和不確定性,那麼使用預印本也並沒有什麼不同。然而,忽視其潛在的問題,講好聽一點是天真浪漫,而最壞的情况下卻是不負責任。   八種易犯的錯誤 將文章發佈到BioRxiv上(或任何類似的平台,如ASAPBio),要小心八個陷阱。   該期刋可能不會認定預印本為其發現的合法聲明,例如疾病治療或新型遺傳技術。而在具有聲望的期刋上發表文章,仍具相當分量。這對事業發展尤其重要,因為它影響早期研究者最甚。   期刊可以選擇直接了當的拒絕預印本手稿。像是新英格蘭醫學期刋(New England…

免費電子書:「您不可不知開放近用之一切」

隨著網路的問世及數位存檔的出現,資訊近接獲取的需求明顯增加。人類基因體計畫(Human Genome Project)是公開和免費獲取資訊的一個重要里程碑。2000年初,諸如Budapest OA Initiative和Berlin Declaration等重要大事成為OA運動的推動者。然而,OA出版的成長路上充滿了許多挑戰,需要採取不同的措施來確保其持續成長。 相較於傳統形式,OA出版不僅有助於提高研究的知名度和影響力,也有助於更快地將知識傳播給學術界。最近有一些疑慮,諸如變化無常的文章處理費(Article Process Charge,APC)、掠奪性期刊、以及OA期刊的品質和聲譽,這些疑慮全都直接影響到研究人員在OA和傳統期刊之間的抉擇。因此,必須要搬開這些路上的石頭,因為它限制了作者和出版商在OA出版上的利益。   透過這本電子書,我們打算教導早期研究人員和學生,讓他們知道關於開放近用出版的好處,以及過去二十年來,學術出版對於研究人員而言是如何發展進化的。我們嘗試去彙編一些關於開放近用運動的里程碑及其利益之基本資訊,也概述OA出版市場,並對開放數據、資料庫和期刊簡明扼要的介紹,以及OA出版品的版權許可。   在此點擊下載電子書 您從「您不可不知開放近用之一切」中可以找到您想知道的資訊。  …