產品及服務評論

ChemxSeer化學搜索引擎

ChemXSeer為整合化學類科學文章的公共數位圖書館和搜索引擎,是由美國賓州州立大學跨領域研究團隊開發,ChemxSeer專案則是由美國國家科學基金會(NSF)資助開發經費。 ChemxSeer有幾項不同於傳統搜索引擎的功能: Chemical Entity Search—可辨認化合物分子式和名稱,並與一般用詞作區別;使用相似度得分、功能排名和搜尋方法來索引不同化學個體。 TableSeer—能自動辨別數位檔案裡的圖表,並萃取表格的中介資料(Metadata)及表格內容,以供使用者搜尋。 Databases—可整合不同來源的實驗數據,並可處理多種檔案格式,例如XML、Mircrosoft Excel、Gaussian、CHARMM;從中建立可直接搜尋的資料庫,利用標記工具建立Metadata,並建立資料組間的連結。 ChemxSeer使用者可利用關鍵字、分子式或化學名稱,搜尋超過44,500件化學文件;另外,也可使用下圖橫列的幾種資料型式進行搜尋;系統並可搜尋excel資料(”Kinetics Database”)及所有計算資料(”All Types”)。     其他功能包括Table Extractor可萃取上傳表格內容,並有ChemxSeer…

WorldWideScience科學搜索引擎

WorldWideScience.org 為一個能搜索全球科學資訊的門戶網站,是由隸屬美國能源部的科學與技術資訊辦公室(Office of Scientific and Technical Information)開發,網站於2007年開張。 WorldWideScience.org 的幾項特色和優點: 整合全球現有超過70個會員國的WorldWideScience聯盟的科學數據庫,可一次同時搜尋所有檢索系統中的科學文獻。 連通一般網路搜索引擎無法搜尋的「暗網」科學資料庫。 多語言即時搜尋和翻譯,包含中文、英語、法語、德語、日語、韓語、西班牙語、葡萄牙語、俄語、阿拉伯語等10種語言。 * 例如下圖所示,若於搜尋時點選「中文」,則結果頁面右上角會顯示「翻譯結果」按鈕,點選後所有的搜尋結果內容便會自動翻譯成中文,方便中文使用者查找。須注意的是,此網頁的中文為簡體中文,有些學術習慣用語可能與台灣有些差別,所以不確定的地方,還是建議同時參考英文或原文內容。 多媒體搜尋功能,可搜索語音科學多媒體資料庫,如ScienceCinema等等。…

PubChem化學文獻搜索引擎

2004年開張的 PubChem 是專門針對查詢化學分子與生物活性的搜索引擎,系統由隸屬美國國立衛生研究院(NIH)的國家生物技術資訊中心(NCBI)維護,擁有上百萬組化學結構和相關文字資料,並可免費經由FTP下載。 從網頁編排便可得知,PubChem主要有Compound、Substance、BioAssay3種資料庫: Compound包含結構已知且少於1000個原子和1000個化學鍵的小分子化合物 Substance除了純化合物外,還包含混合物、萃取物、絡合物以及結構未定的物質 BioAssay包含1644項高通量篩選計畫的生物活性數據 PubChem除了有與PubMed相似的文字搜索功能(請參考「PubMed期刊論文搜尋引擎」),還提供多種符合化學研究者需求的貼心搜索功能,例如化學結構、名稱片段、化學式、分子量、脂水分配係數、氫鍵給體和受體數等,除此之外,還可線上畫結構或片段來作搜尋,並有CID, SMILES, InChI系統可輸入和輸出所有常用化學檔案格式。 而每筆搜尋結果包含同義字、化學特性、化學結構、生物活性、相關化學結構、其他NCBI數據庫(例如PubMed)的網頁連結等有用資訊。 PubChem目前是化學界學者熟知的美國化學學會(ACS)化學文摘服務搜索系統(cas.org)的最大競爭對手。   參考資料: PubChem化學文獻搜索引擎…

GoPubMed生醫搜索引擎

我們之前提過的「PubMed期刊論文搜尋引擎」,經年累月以來,已有超過1千5百萬的生醫類文獻;然而,資訊量過大隨之而來的問題便是無法有效率地找到想要找的文獻。為了解決這方面的問題,德國德瑞斯頓工業大學(Technical University of Dresden)與Transinsight公司於2005年共同開發了GoPubMed網路伺服系統。 GoPubMed利用Gene Ontology(GO,基因本體)理論來對PubMed資料庫進行標籤及搜尋。GO是一項生物資訊專案(請參考Gene Ontology website),目的是統整生物領域間對基因和基因產物的用語,改善學術溝通、資訊分享等問題。GO包含三個部份: Cellular component—細胞的組成「零件」和細胞外環境 Molecular function­—基因產物的分子功能,例如結合或催化 Biological process—生物體內與特定生物功能相關的分子過程 GoPubMed使用GO原則分類各文獻的摘要,GO分類標籤並顯示於所有搜出的文獻上,讓使用者能依照分類快速掃過各摘要,大大減少找到想要的資訊的時間。…

Microsoft Academic Search 學術搜索引擎

微軟學術搜索(Microsoft Academic Search)是由微軟公司的研究部門(Microsoft Research)研發的免費學術搜索引擎。所用的資料庫有多達3800萬的學術文獻和1900萬個學術作者,並且每周更新網頁資訊。有別於其他學術搜尋網站,微軟學術搜索最大的特色在於搜索數據的視覺化,能夠幫助使用者更直觀的查詢分析資訊。 除了文獻搜索外,目前微軟學術搜索提供的服務還包括個人資料頁、視覺化搜索、會議文章徵文、學科趨勢、用戶編輯等。跟其他學術搜索網站類似的功能我們暫時就不多提了,在這節,我們將帶大家一起探索微軟學術搜索幾項有趣的視覺化搜尋功能! 學術地圖 (Academia Map) 配合Bing的地圖數據,學術地圖能迅速顯示進行多達15種研究領域的研究機構,以及其地理分布、作者數量和論文發表數量。我們拿台灣的computer science為例好了(下圖左),搜尋結果清楚地標記了台灣所有有computer science的學術機構。如果繼續點選任一個色點,該機構的所有相關領域的研究員的姓名和大頭照也以會以圖案的方式顯示出來(下圖右),也可以選More觀看完整的列表;還可以繼續點選各大頭照,查看個人資料。     學科趨勢(Domain Trend)…

醫學主題詞表(Medical Subject Heading )

醫學主題詞表 (MeSH) 是由美國國家醫學圖書館 (NLM) 所出版的控制語彙表,也是所屬 Medline/PubMed 資料庫的索引典,因此,MeSH 健康與醫學文獻來源為 NLM 所屬各種學術資料庫。MeSH 於 1960 年首次獨立出版。 MeSH 可以對照字彙搜尋,賦予搜尋更明確的方法。換句話說,除了索引、分類及搜尋生醫與健康相關資訊與文件,也能尋找同義字、接近同義字及密切相關概念,納入作為輸入語彙,找出最相關的…

PubMed期刊論文搜尋引擎

PubMed是免費搜尋引擎,提供超過 2100 萬筆,來自 MEDLINE、生命科學期刊及線上圖書,有關生醫學方面的論文搜尋與摘要。其核心主題雖然為醫學,但也包括其他與醫學相關的領域,像是護理學或者其他健康學科。同時也提供對於相關生物醫學資訊上相當全面的支援,像是生化學與細胞生物學。此搜尋引擎是由美國國立醫學圖書館 (NLM) 提供,作為 Entrez 資訊檢索系統的一部分。PubMed 的資訊並不包括期刊論文的全文,但可能提供連結至全文提供者(付費或免費)。 如同所有搜尋引擎一樣,一定要自己親手操作過,才會知道其優缺點。首先進入 PubMed首頁,然後按照畫面指示,嘗試使用看看。 左上方的欄位可選擇不同資料庫。 在輸入查詢關鍵字時,下方有兩個選項,「Limits」是根據系統內建欄位,設定所需的搜尋條件,而「Advanced」則可自行組合進階搜尋欄位。 Limits 搜尋可設定發表日期、文章形態、人類或動物研究、領域中的小分類、摘要或全文、語言、性別、年齡等。…

免費網路搜尋引擎 Scirus

Scirus 為免費網路搜尋引擎,提供研究人員、學者、學生有關「科學」搜尋的結果,包括最新報告、同儕審閱文章、專利、出版前的文章及期刊等。 一般而言,蒐集資料的工作總是曠日費時,要精確找出適當的搜尋結果,並不是一件容易的事,個人必須對主題作出良好的判斷,運用平日從事研究得出的經驗,選擇正確的關鍵字進行搜尋,才能確實得到需要的結果。科學搜尋引擎 Scirus, 根據相關性而得出搜尋結果,確實可以減輕不少搜尋的困難之處。 Scirus 的搜尋方式,從最基礎的等級開始,先輸入關鍵字,然後再逐漸縮小範圍,進階搜尋。Scirus 搜尋設定的預設值,是以「相關性」來排列搜尋結果,另外可改用「日期」作為排序的選項。如果點選「日期」作為排列順序的依據,則是以時間順序來排列與主題相關的搜尋結果,也就是日期越後面的資料,位置越上方,這樣有助於區別搜尋到的消息是否「新鮮出爐」。 接下來,搜尋結果的左側會顯示搜尋分類,例如:期刊來源(Journal sources)、主要網站(Preferred web)、檔案類型(File types)等,有助於精確找出正確的資訊。總而言之,不是毫無選擇性的顯示所有結果就是好事,一筆一筆檢查搜尋內容,不過是在浪費寶貴的時間。利用搜尋分類來縮小搜尋範圍,過濾掉不相干的資料,才能迅速找出有用的訊息。 Scirus 所顯示的結果來自期刊與網路,這些結果的顯示順序,是從最高相關性一直減少到最低(預設值)。這種排序方式所表示的相關性,是根據下列項目判斷: 1.…

Scopus, SciVerse Scopus

Scopus 為最受歡迎的引用文獻資料庫之一(請參考「引用文獻資料庫 」),是目前最大的同儕審閱文獻摘要及引用資料庫,也是品質良好的網路資源,涵蓋來自超過 5000 家出版社,將近 18000 本期刊。 Scopus 通常是由學校團體或研究機構訂閱,然後讓所屬成員經由內部網路,或是以遠端進入的方式,隨時可以查閱資料,當然外部的人員來到該機構,也可利用機構內的電腦查詢。 Scopus 可支援多元化的查詢方式,最常用的有: 快速搜尋:利用標題、摘要、作者關鍵字、索引關鍵字及作者等欄位,進行文章搜尋。 作者搜尋:輸入作者名字,即可找出該作者所有作品。 搜尋結果以表格形式呈現,可利用附加欄位,例如:來源期刊、作者名、發表年份、文件型態及主題領域等,進一步篩選得到更接近需求的文章。大部分文章都有摘要及參考文獻的部分可供查看,至於全文內容,就要配合圖書館訂閱系統,是否有權限進入觀看線上期刊完整內容。Scopus 也可從一篇文章,直接連接到該篇文章所引用的參考文獻(1996…