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英論閣學苑

給青年科學家的自存檔指南

開放近用的科學越發受人青睞。由於開放獲取期刊的出版費與訂閱費漲幅之高，而期刊出版成本隨著產生研究實際影響力的需求而高漲，自存檔（self-archiving）從而蔚為潮流。幸運地，自存檔已成為共享研究的合法途徑。自存檔研究允許作者將原稿發表在機構或個人的數據庫，從而允許他人免費或近乎即時地取得研究成果。不論付費能力，對科學家保證開放獲取的渠道，有助於最大限度地發揮研究影響力。 自存檔面面觀 出版模式有許多種，其中包括「金色」與「綠色」模式。金色開放獲取允許任何人通過網路免費取用研究文章，然而作者需負擔發表費用。有時候這些費用超乎常理，每篇文章竟收取高達三千美元！作為替代方案，綠色開放獲取則允許作者將論文儲存在數據庫中。這些文章也許會經由前同儕評審或後同儕評審，其中囊括了世界各地研究人員所有寶貴的見解。使用這類數據庫有利也有弊。想當然爾，數據庫免費近用，不啻為一個極佳的數據出處。不巧地，這些種類數據庫中的文章品質往往取決於上傳者。 不管怎麼說，自存檔最終會加速共享數據的過程。如何使用自存檔以及要存什麼檔無非是一個困難的決定，因為出版方權利與未來發布權，可能會因過早涉入自存檔而受到危害。例如，當作者持有一份預印版本，該版本並沒有經過同儕評審或其他期刊風格編修。此外，出版方有時禁止發布過去可用資料，即使該資料已存在數據庫中。試想，當出版方不接受已存取在數據庫中、在網路其他地方開放獲取的原稿時，作者該如何發布研究？ 在何處進行自存檔，又如何進行？ 如果您選擇開放獲取出版模式，這裡有幾個現存的數據庫值得考慮。開放獲取數位物件識別號（oaDOI）准許免費近用文章。藉由搜尋免費近用版本，文章會接著被連結到DOI。如此一來，讀者可憑著DOI搜尋文章，並且找到該文章的免費版本。 現存的幾個自存檔數據庫有： arXiv、bioRxiv、PubMed Central、SSRN以及更多 機構數據庫，如美國加利福尼亞大學數位圖書館（California Digital Library） 自存檔的出版方針 在進入數據庫前，確認您的目標期刊是否有禁止期或預先收費。這個步驟可使用SHERPA/RoMEO簡單搞定。 不像期刊，出版方通常是制定方針的一方。例如，Wiley同意已提交的原稿預印版本可隨時自存檔，儘管經認可（同儕評審）的版本可能要在禁止期後提交。此外，可存取的同儕評審版本有時需要一份同儕評審聲明，以及一個可連結至原稿所屬的期刊的鏈接。…

9 years ago

政策出版社與Enago合作，提供手稿準備服務

美國紐約政策出版社今天宣布與Enago合作，Enago是一家居領導地位的作者服務提供者，主要專門針對英語是第二語言（ESL）的大部分全球研究社群。 政策出版社成立於1996年，是英國布里斯托大學(University of Bristol)社會科學與法學院的學術出版社。它專門從事社會科學，旨在以出版品來改善社會狀態。而此出版品致力使學習與研究、政策和實踐產生積極的改變；它出版的各種產品則包括教科書、學術期刊和專題著作。 Enago在為全球研究社群的作者服務中，是一個受信任的代名詞。自2005年以來，Enago與125個不同國家的100,000多名研究人員合作，改進了他們的研究交流，幫助他們的論文成功獲得國際出版。Enago是全球居領導地位的學術出版社、學會，以及大學的首選合作夥伴。Enago在東京、首爾、北京、上海、伊斯坦堡和紐約都設有辦事處，並與區域團隊以全球性合作來支持當地研究人員。 政策出版社銷售及市場總監Julia Mortimer說：「與Enago的夥伴關係使我們能夠為世界各地的研究人員提供語言編輯服務。Enago的服務有助於提高作者提交到出版社的手稿品質，畢竟英文不是作者的第一語言。」 Enago全球運營副總裁Rajiv Shirke則說：「Enago很高興與政策出版社，以及甫投入的布里斯托大學出版社合作，透過提供容易獲取的高品質手稿準備服務，幫助全球學術界，滿足其需求。我們很高興能夠藉以其提交的論文，來支持政策出版社作者。」

9 years ago

B2J：BioRxiv的新提交程序

研究人員正朝著新的方向發表科學研究論文。有鑑於同儕審查過程中所牽涉到的時間、發布者和作者之間的提交往來、評審對數千篇提交論文所面臨的壓力，研究人員正在尋求一種更新、更有效的方法來發布。有一種方法在科學家已經開始流行了，是直接在線上提交未發表的手稿，而無需同儕審查。為了適應這一點，康乃爾大學圖書館在1991年在創建了知識庫arXiv。arXiv涵蓋數學和科學的所有領域，包括計算機科學。為了簡化流程，生物學家的知識庫bioRxiv的版本則是由冷泉港實驗室(Cold Spring Harbor Laboratory)，在2013年由專門用於生物醫學研究創立和推出的。 BioRxiv和B2J 根據最近的一篇文章，bioRxiv在2013年出版了108篇論文，而到2016年共出版了4713篇論文。今天，該網站已經收錄了來自55,000位作者的10,000多篇論文。90多個國家都已經有這個服務。這些開放獲取，非同儕審查的研究論文，是提供給任何人的。為了符合科學界的目標，特別是其研究目標，開放獲取出版可以讓任何人皆可讀取到科學的最新發展。這對行業主要的好處是確保可向所有人傳播訊息，而不僅僅是只為少數人或願意付費的人服務。此外，訪問論文的讀者都可以在線上評論，這也促成了讀者意見可以公開交流。 在bioRxiv系統中發表的文章，分為以下三個分類之一： 新結果：大多數包含新結果，因此這是最大的類別。 確定的結果：研究其他研究中已經確認存在的結果。 矛盾的結果：通常是最有趣的，並且允許機會或辯論。 雖然出版商通常不允許在多個期刊中提交或發表論文，但許多人會把這些bioRxiv預印本作為新訊息的接收管道，或允許作者將其論文直接提交給其他期刊。此外，其他研究可以使用他們的DOI來作為引用。透過新創建的bioRxiv提交服務，其名稱為B2J，那些使用bioRxiv系統的研究者可以輕鬆的把他們的預印本上傳到任何參與的期刊。引述自Crosstalk的文章，有兩個開創性的期刊「Cell Reports 」和 「Structure」，正在參與這項服務，並且歡迎來自用戶的反饋。 支持和利益 ASAPbio，發起於2015年，旨在促進科學訊息的迅速傳播；而BioRxiv得到ASAPbio的支持。ASAPbio的主要資助者是Alfred P.…

9 years ago

Almetrics和PubFactory團隊追蹤出版品數據

研究人員有個古老格言：出版或滅亡在競爭激烈的學術歷程中可能是真實的，但它並未培養有意義的科學社群。一個科學家應該要知道，他們的工作是如何被接受的，誰在拜讀。由於出版品是研究的核心，所以期刊試圖提供作者服務，包括讀者和社群媒體分享指標。數據科學公司Altmetrics和PubFactory正在努力達成這一點。 當出版手稿時，雜誌的影響因子提供給讀者一個想法，如何去讀好這篇研究。然而，影響因子實際上並不能真實顯示出個人出版品的讀者數量，也不能顯示出該出版品的被接受的情形。例如，在低度影響期刊上的出版品可以在社群媒體上得到廣泛的引用和討論，但是您不知道這些期刊，這是因為期刊影響因子的因素！因此，這種合作關係將可透過Altmetrics為PubFactory所建立平台上所託管的參與數據，提供新的觀點和相關的見解。 兩家公司的故事 作為數據科學公司，Almetrics允許研究人員去追蹤個人研究的線上交流，包括是誰參考，或是透過社群媒體和新聞媒體來進行交流。一旦將研究數據上傳到PubFactory的線上平台，科學家就可以找到一個奇妙的機會來追蹤他們工作，這對社群產生有意義的影響！ 許多主要學術出版者，包括哈佛大學出版社和現代語言學會，已經開始使用PubFactory了，在這個平台上託管了1400多種期刊和40萬本書。PubFactory最近透過與Altmetrics合作，提供了關於出版傳播的數據來改進其對作者的服務。 對於接觸出版品有更好的洞察力 科學家的發表在出版後，去了解他的研究在不同領域的知名度是非常重要的。科學家可以簡單的瀏覽他們在PubFactory的文章，而不是單單藉由影響因子，或等待看到有下一個人推出一個令人興奮的新出版品。科學家可以從Altmetrics所提供的指標來了解，例如引用、社群媒體的分享，或新聞稿提示等。從這裡可以了解研究人員工作對於其他讀者的持續影響、讀者的背景，也可以知道誰在拜讀這篇作品，為什麼讀者會認為重要。此外，這些指標也反映了出版後，在實驗室外的相關文章或重要事件，藉此來分析最新數據。 最終，這種合作夥伴關係提供了關於出版品傳播之後的即時反饋。Almetrics的首席營運長Kathy Christian認為這種新的合作關係可以使作者能夠立即追蹤和量化他們工作的影響。數據科學公司擁有數據管理的強大資產，而在作者服務上提供最新進展，必能加快學術出版的有效性。隨著科學家們繼續致力於新的研究視野，Altmetrics和PubFactory的新工具將幫助科學家們分享他們的工作給更廣泛的受眾。

9 years ago

Elsevier從Sci-Hub尋求以百萬計的侵權費用

在科學出版商和具有游擊隊型態的開放獲取網站之間仍然在持續戰鬥中，紐約法院裁定，這些海盜網站合計虧欠出版商Elsvier 達1500萬美元。Sci-Hub和LibGen(the Library of Genesis)這兩家在這個訴訟案件中被具體指名。紐約法院發出禁令，命令Si-Hub停止提供Elsevier內容的獲取訪問。然而這個網站卻繼續運作。Elsevier將無法從Sci-Hub收到任何款項，因為Sci-Hub並不在法院的管轄範圍內，而且Sci-Hub在美國沒有資產。 有關Sci-Hub的爭議在於，開放獲取需求與避免侵犯版權活動的重要性之間的緊張關係的前沿。 Sci-Hub是由神經科學家Alexandra Elbakyan於2011年創立，是一種游擊隊型態的開放獲取網站；它從俄羅斯使用各種網域名稱和IP位址來運作。數以百萬計的版權作品在Sci-Hub上免費獲取。大約69,000名使用者每天免費從Sci-Hub下載超過20萬張論文。 Elsevier的法律團隊認為這對於版權是一個嚴重的侵權行為，法院裁定應付予1500萬美元的盜版損失費用。Sci-Hub和LibGen對其侵犯版權的罪刑也無可否認。會存在這種類型的學術盜版，因為需要在付費牆之後的當前資訊。提供游擊隊型態的開放獲取網站往往會收到來自開發中國家的大量流量，這些國家的期刊訂閱費用往往都太高。而問題是，游擊隊開放獲取模式畢竟是無法永續的；它既不能確保發表的作品永久可用，也無法對新數據進行同儕審查。 即使Elbakyan面臨了侵權案件，卻依舊保持著Sci-Hub改變學術出版業的動力。很顯然，Sci-Hub所代表的侵權型態是前所未有的規模。像是Elsevier，Springer Nature和Wiley-Blackwell這樣的大型科學出版商所擁有版權，大約只有Sci-Hub免費版權的一半。這顯然是被Elsevier法律團隊成功論證的重要版權案件。游擊隊式的開放獲取可能有助於那些被收費牆限制的人，或許在那些人的眼光中是俠盜、刺客；然而，它依舊是侵權！

9 years ago

智慧夥伴同儕審查成功測試

由Thieme出版的國際化學雜誌Synlett已經成功地嘗試了一種新的同儕審查形式，旨在使稿件評估更快、更公正。該雜誌的主編，德國的Max Planck煤炭研究所的Benjamin List及其博士生Denis Höfler將其新方法稱之為「智慧夥伴」同儕審查。這種方法允許大量的受認證的審查人在線上對手稿發表評論。 研究人員將發展這種傳統同儕審查系統的替代方案，使其被大多數學術期刊使用。根據Benjamin List所說，目前的程序仍然是鴨子划水；他主要是批評是審查人的人數太少，通常只有兩三人，以評估論文的品質。 在新方法中，許多同儕可以在短時間內在線上訪問獲取，並且評論手稿，這使得該方法可能更快更可靠。在與Synlett的測試案例中，編輯根據編輯委員和自願參與的研究人員建議，選出了100位審查人。之後，這些審查人被允許對十份提交的論文發表評論。 Synlett團隊認為，新系統可以更有效，可以剔除掉有偏見的審查人。這個測試在2016年進行，所有參與手稿在幾天內吸引了夥伴的合格評議和討論，這有助於編輯們做出更快且更公正的決定。所有評論都是匿名的，這可以確保報告是直白、坦率，而且是挑剔且吹毛求疵的，有時候這卻是必須的。雖然這些評論可能是真的，盲目同儕審查和雙盲同儕審查也各有缺點。 其他線上方式，如出版後同儕審查，其工作方式類似。不過，在這些情況下，任何公眾人士都可以匿名發表評論稿。在這種情況下，濫用和不合格審查不能完全剃除剔除。而在智慧群體同儕審查中，編輯們認識所有審查人，所以可以避免上述問題。 出版商和Synlett的編輯團隊對審查結果感到很滿意。根據化學雜誌的編輯，審查人和作者也都對結果感到滿意；參加研究的十本手稿中，有九篇終於被公開發表。該雜誌希望將新的同儕審查系統可以擴展到所有手邊處理的論文。    

9 years ago

FindMyJournal™：為您的論文尋找正確的期刊

如果您比別人早研究幹細胞，您的研究領域將會是獨一無二的。但它卻不止於此，您可以在移植幹細胞衍生的肝臟後，研究動物模型的免疫反應；那麼此時您的研究和知識是獨一無二的。那麼，要為您的文章找到完美的期刊，是不容易的任務。使用所有出版商列表來尋找，那可以花幾天時間搜索，又不見得是正確的期刊。現在，有一個簡單的期刊搜尋工具：FindMyJournal™。 那麼如果您的論文被投稿到錯誤的雜誌，那會怎麼樣呢？您可能要先熬過幾個星期的漫長等待，最後盼到編輯的拒絕；或是繼續等待幾個月，等到適合的同儕審查，每位評審都會說您的論文是好的，但是，這篇論文卻與這本期刊不匹配。經過幾個月的時間，收集數據，並撰寫一份精闢有洞察力的手稿，卻誤投到一份認為本篇論文超出其範圍的期刊。那將叫自己情何以堪？ FindMyJournal™的主要特點 FindMyJournal™在其資料庫中包含超過29,000個期刊。這些SCI索引期刊的學科落在醫學、生物和物理科學類，覆蓋4000多個研究領域。此外，它包括由Elsevier、Springer、Wiley和Sage發表的期刊，以及Scopus、PubMed和Web of Science中的期刊索引。經過簡單的搜索，將列出最佳匹配的期刊，並將產出每個期刊的功能表。這將有助於您決定將哪個列為第一首選來投稿，使其在同儕審查期間等待是值得的。 用戶指南 打開FindMyJournal™後，您將找到一個對使用者很友善的網站，幫助您瀏覽數以千計期刊。該網站所利用的大部分過程，倚賴專利技術和專有的邏輯算法來找出最能與您的論文匹配的五個期刊。 開始時，只需簡單註冊即可免費開始搜索。一旦登入，您將被要求提供有關您的論文的資訊。他們會問11個簡單的問題，根本不需要很多時間來作答。簡單來說，這些問題會問有關於： 您的手稿的研究領域或學科領域 您的手稿中最常引用的其他期刊 文章類型：獨創的基礎科學、臨床、評論文章等 您提交後希望的出版速度 一旦出版，您更喜歡稿件的可獲取性 您的手稿的一些描述性關鍵字…

9 years ago

應該使用哪些工具來為研究論文設計出高品質的圖像？

手稿可表達這數個月或數年來，從一連串實驗中所收集到的數據。然而，原始數據或敘述本身並不足以成為好的期刊論文。數據視覺化工具和免費繪圖軟體能够讓科學家解釋他們的科學故事。絕大部分的讀者的閱讀習慣，一向是有圖先看圖，有表先看表，有公式先看公式，最後才看文字。以這些工具來使科學插圖更加完善，可以牢牢地抓住審稿人的注意力。更重要的是，它將有助於讀者快速了解數據，增加引用和分享研究論文的可能性。   為什麼圖像品質很重要 期刊對於圖表/圖像的品質有嚴格的指導方針，例如每個圖像的像素數(pixel number)或是解析度(每英寸多少像素點，DPI)。如果圖像品質不好，則編輯或其他工作人員將會在審查之前，便把手稿給拒絕掉。此外，品質差的圖像會給讀者和審稿人留下不好的印象。所以在編輯和製作科學圖像時，一定要使用科學文章專用的插圖軟體或繪圖工具，使您的數據清晰易懂！ 讀者的閱讀往往時間很短，而表格可以迅速傳達數據給讀者。因此，當您設計表格時，可以花點巧思，讓您的論文可以產生更大的影響力。因此，您的表格應該清晰明確且具有描述性的表抬頭，每個欄位的定義要明確，每個儲存格中的資料應適當對齊，讓讀者能一目瞭然，或是方便比較。也因此，研究人員可以使用適當的工具來創建出版品的圖像。 一般工具的用途和限制 現在軟體很發達，作者可以挑選許多的工具使用；而選擇哪一個工作，要取決於你的電腦知識、預算和所希望得到的結果。 R，是一個免費的統計計算程式，適用於各種作業系統，有利於圖形的開發。它的優點是：即使欠缺有關賦予圖像真實化(rendering)的設計條件，但是依舊能輕易的產生具有出版品質水準的圖。由於R是免費的，所以它不會像訂閱服務所提供的軟體那麼方便使用，例如Prism，是隨著訂閱服務而提供允許數據分析和圖表開發的軟體。 ImageJ，是由美國國家衛生研究院(National Institutes of Health)開發的免費軟體。簡單來說，它是一個圖像處理程式，允許使用者編輯、分析、處理、保存、列印、修改顏色和圖像定量。它有一個很特殊的功能，是它能够從影片產生堆疊(stack)，也就是一系列圖像，或是將照片轉換成影片，這有助於活細胞成像。 Inkspace，是一個高品質的向量圖形編輯器，是一種開源軟體(open source…

9 years ago

學習如何避免被期刊拒絕

學習如何避免被期刊拒絕 在學術出版方面，各家期刊拒絕率可能會差很大。根據美國心理學會在2013年的報告中指出，其頂級期刊的拒絕率平均為76%。身為世界上最大出版商之一的Elsevier，宣稱其為30~50%；而在2013年Nature Materials的文章中，根據報導約為87%，在同儕審查後被接受只有約60%。對於花整年時間規劃研究，籌募資金，蒐集和分析數據，以及做出有利於讀者的正確結論的學者而言，這是非常沮喪的。在將手稿提交到出版刊物之前，應先做足功課。要去充分研究該期刊的標準和格式，並了解其拒絕的理由。能夠先防範最常見拒絕的理由，將有助於確保稿件接受一次徹底完整的審查，這樣就可以解決任何問題和疑慮，並重新投稿。 拒絕的理由 管理教育期刊，Journal of Management Education (JME)的編輯Jon Billsberry指出：「與一般看法相反，編輯不喜歡拒絕意見書」。他在 2014年的社論「Desk-Rejects」中寫道：「十大提示，避免淘汰」。Billsberry指出，儘管他的期刊中有明確的作者指導方針，也經常在學術會議及研討會上提出，然而作者卻繼續提交不合格的論文。Billsberry，與Carbon Journal的主編Peter Thrower博士提供了文章被拒絕的最主要原因。 技術篩選 領域…

9 years ago

2017年期刊引用報告揭露最具影響力的期刊

2017年期刊引用報告揭露最具影響力的期刊 如果您是經驗豐富的研究員，您當然已經知道了這個問題的答案；但是，如果您剛開始從事研究領域，你可能不理解諸如「影響因子」之類名詞的重要性，以及其他期刊對你所從事學科的影響。在這裡，我們提供了2017年最有影響力期刊的資訊。 期刊引文 期刊被引用越多，其在專業領域的聲譽就越大，而且其貢獻對於當前的研究成果而言，可謂是現在進行式。由於全世界每年有數以千計的期刊出版，似乎造成文章過剩；在此狀況之下，仍有少量期刊卻擁有大量的引用次數，這顯示出其對學術領域的影響。測量某一特定期刊的引用數，是評估其影響的一種重要方法。但須指出，這些指標不一定能衡量出版品的品質，但它是一個主要的量化措施。 有幾個衡量期刊影響的指標，如期刊影響因子(Journal Impact Factor)、即時指數(Immediacy Index)、特徵因子(Eigen Factor)，或H指數(H-Index)；然而，最有影響力的是期刊影響因子，這個指標可謂是當今主流，經常列在期刊的主頁上。 影響因子 影響因子是經由簡單的數學計算，以論文數量除以引文的數量；不過論文也會使用其他方法來評估期刊，這些具體方法的亮麗積分也有助於建立期刊的影響力。這些包括出版行業的具體標準，如同儕審查協議、出資者和董事會成員之間的差異。期刊還必須通過確保其出版作品的連貫性和可信性來建立一定程度的讀者忠誠度。 那麼，由誰來評估期刊的影響呢？ 期刊引用報告 自1973以來Clarivate Analytics評價了期刊的統計資訊，來評估一個期刊的影響力（例如，引用數據或是使用科學引文索引網頁的其他指標）。每一年，Clarivate…

9 years ago