A Crash Course on Biostatistics | Part II
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科學研究發表於期刊中,多年來逐漸形成了目前的流程、習慣與弊病。再現性問題是許多科學家親身經歷的。近年來,多項大型再現性研究試著分析已發表的癌症研究及社會科學研究,竟發現各有約30%的論文結果無法重複,其中竟包含發表於高影響力期刊的論文,科學界因此受到再現性危機的震撼。「失去信心計劃」(Loss-of-Confidence Project)被發起,鼓勵學者們大膽公開坦白對自己實驗已失去信心,欲幫助提升實驗再現性。 而另外一項最新提議來自知名史丹佛教授Steven N. Goodman,發表在《自然》:他提出學者應為論文中的數據附上「信賴指標」(confidence index),估計出研究發現為真的機率。 用「信賴指標」取代P-value Goodman強調,目前太多的論文結果都以P<0.05來說明其結果可信。然而,這個指標容易被誤解:P-value並不能代表結果的可信度,受到許多統計學設計的限制,而0.05這個內定值也並沒有足夠依據。美國統計協會也在2016年特別聲明,正式提醒學術界切勿過度依賴P-value。 因此,Goodman提出「信賴指標」的概念,應從各方面完整地統計出對實驗結論的信心。其計算中應包含過去研究結果、學者的經驗判斷及實驗限制等多方面因素,並結合貝氏統計法,真正統計實驗結論為真的機率。 P-value的敝病 現在學術界對於P-value的依賴非常大,所有論文要發表都要P<0.05。因此,往往學者們會受壓力去操作數據,想盡辦法讓P<0.05。這種作法本末倒置,反而讓發表的原始數據失真,是科學界一大弊病。 再現性危機當前,「信賴指標」的應用能解決各方面的弊病:能更全面、完整地呈現結果,並預防投機取巧的P-value操作。
剛開始著手新的題目時許多人都有共同的經驗:輸入一個關鍵字來查找期刊和資料庫時,出現成千上百則條目,令人不知所從!在這眾多條目裡,與自已研究問題直接相關的論文,或許不到十分之一,若憑人力海搜再一一揀選太浪費時間和精力,這時可考慮採用布林運算子(Boolean operators)進行更有效的期刊檢索與資料庫搜尋。 如何使用布林運算子? 最常用的布林運算子是AND、OR、NOT,可用來縮小(如使用AND、NOT)或擴大(如使用OR)查詢的範圍,提高文獻檢索的效能。布林運算子並非只能搜查主題關鍵字,亦可輸入作者名字或文章類型做為檢索依據。 布林運算子可單獨使用,例如輸入第一個關鍵字AND第二個關鍵字,搜尋結果便都包涵這兩個關鍵字。也可以視需要混用布林運算子,例如輸入第一個關鍵字OR第二個關鍵字NOT第三個關鍵字,這樣一來,搜尋的結果便是有關第一或第二個關鍵字的文章,但排除了第三個關鍵字的條目。 看一下這個實例,僅用關鍵字在PubMed檢索有關HIV的研究時,出現資料多達9845則,然透過各種布林運算子的排列組合後,便能找到十數則至一百多則更具相關性的論文,節省寶貴的時間和資源。 布林運算子 關鍵字搜尋 搜尋結果 None HIV transmission intravenous sexual 2353…
台灣的科學研究長期以來穩定前進,不斷站上世界舞台上。2018年12月再報捷訊,AAHRPP新認證的四個研究機構,三個在美國,而另一個就在台灣。 臨床研究受試者保護評鑑協會 (Association for the Accreditation of Human Research Protection Programs, AAHRPP) 總部設於美國,專為全球臨床研究機構進行評鑑、認證。其評鑑項目包含三大領域:機構、倫理委員會、研究人員,近百條細項包含研究品質、溝通平台、受試者安全、個資保護、利益衝突、研究人員訓練等各方面規範,目的在確保研究機構擁有完整的架構及程序,從上到下有共識地進行高品質、合乎道德、進步的臨床研究。其中每一個項目都必須提供具體流程及證明文件,總數可能500件以上,各項評鑑均通過才能獲得最終認證,相當困難 。 2018年12月,AAHRPP公佈了最新認證名單,四個研究機構中,台灣的高雄醫學大學附設中和紀念醫院就名列其中,是一項意義非凡的重大肯定。自2012年以來陸續通過AAHRPP認證的台灣研究機構包含台大醫院、台北醫學大學附設醫院、長庚醫療財團法人等共10個。…
台灣政府從各方面鼓勵科技業發展、走向國際。科技部帶領44家台灣科技新創公司進軍美國拉斯維加斯CES 2019電子展,更有8家公司產品榮獲創新獎。 國際科技創業基地(Taiwan Tech Arena, TTA)是科技部在2018年中設立於台北小巨蛋的科技新創育成空間。已有45家科技新創公司團隊進駐,產業包括先進製造、人工智慧、網路安全及軟體、醫療與生技、物聯網及穿戴裝置等,更提供各式補助計劃,鼓勵國外新創公司前來台灣交流。 科技部部長陳良基於2018年12月19日在TTA宣佈將帶領TTA中44家科技新創廠商至美國拉斯維加斯參加消費性電子展(Consumer Electronics Show, CES),以Taiwan Tech Arena為主題設置台灣國家館。這是繼2018年後,科技部第二次率領台灣科技新創公司參展。2018年32家公司參展、2家得獎,今年又再創佳績。 CES是自1967年以來的年度電子科技大展,集結了全球領導創新的科技公司,今年超過4,500間公司參展。歷年來多項突破性的科技產品首次發表於CES中,是世界電子科技消費產品的盛會及趨勢指標。 每年CES都會頒發創新獎。以五個項目進行評分:工程品質、美學設計、產品功能的價值、獨特性與新意、與同類產品的比較。CES 2019台灣有8家廠商獲獎。…
科技和工業發展解決了人類許多問題,居住舒適、世界通行、醫療先進,都是拜科技研發所賜。然而,這些發展卻也帶來全球暖化和層出不窮的環境汙染問題。近年來台灣也持續上演開發與環保的拉鋸戰。2018年11月17日,為了保護台灣獨有的藻礁生態,環保團體抗議中油在觀塘工業港的液化天然氣接收站興建計畫,舉行「牽手護藻礁」活動,受到國際學術期刊《科學》報導。 台灣中油興建第三液化天然氣接收站,科學家示威抗議 政府打算以天然氣、再生能源及燃煤發電應付2025年停用核能後的供電需求,已通過中油在桃園的觀塘工業港興建液化天然氣接收站的申請。這個接收站將從工業園區擴建出來,占地9平方公里,。 然而,在預定地海岸線外延申著長達27公里的壯觀藻礁。這經過7,500年由各種石灰藻類鈣化形成的藻礁,是許多特有和瀕臨絕種生物棲息的重要生態。科學家認為這個接收站的興建會破壞藻礁生態,造成無法彌補的損失。另外,環境評估結果反覆,備受爭議。為此,大約100人在大潭藻礁區示威抗議,為環境保護盡一份心力。 而中油在致《科學》的聲明信中回應,說明接收站的設計中已考慮營養成份在洋流中的循環及防止海沙埋礁等保護措施,並預計設立專門審查環境保育問題的委員會,把環境影響減到最低。 這次活動是自2017年以來一連串台灣科學家領導的抗議活動的最新示威,希望能號召全民的力量影響中油及政府的決定。會如何發展,有待更多民眾關切,以及多方利益的競逐和妥協。
台灣的科學研究不停邁進,走在世界舞台前線。世界經濟論壇的2018年全球競爭力報告中,台灣在140個國家中排名第4,超越中國及南韓。而其中最出色的是創新能力這一項,研究發展為評分標準的其中一環,台灣排名全球第4、亞洲第1,更被稱為「超級創新者」。中央研究院是推動台灣研究的龍頭,也是首要指標。 中研院舉行國際學術高峰論壇 2018年是中央研究院的創院90週年,舉行一系列慶祝活動。11月12日,來自美國、法國、日本、澳洲、捷克、印度、以色列、拉脫維亞、菲律賓、新加坡、瑞典、泰國、英國、哥倫比亞等國的代表來到台北的中央研究院進行一整天的「國際學術高峰論壇」系列演講,講題包含國家科學院所扮演的角色、面臨的問題、以及未來的發展。 沖繩科學技術大學院校長Peter Gruss在演講中提到一項台灣特有的發展機會:全民健保系統匯集的大量資訊,有利於人工智慧的開發,值得進一步發展,讓醫療從治療導向預測與預防。 另外,來自法國、日本及拉脫維亞的代表也分享了與台灣學術合作的經驗,將繼續維持合作關係。 科學界近期面臨衝擊 許多學者都提到目前科學界面臨的挑戰:這些包含「假新聞」盛行、研究品質問題、認為研究是「特權階級」產物而生的反智氣氛等。這些現象都讓一般民眾對科學研究的興趣和信心減低,有賴更有效的科普教育與訊息傳播。 中央研究院邀請了全球各地學者進行交流,刺激各國學者向共同目標前進。
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台灣的科技近年來突飛猛進。台灣積體電路製造公司,早為世界第一晶片代工製造廠,在中部科學工業園區最近推出全新10奈米製程的高端晶片產品,還有更尖端的7奈米製程晶片,銷售成長創新高。台灣三大科學園區近八個月的半導體總銷售量也高達1.13 兆台幣。台灣研究界也在世界舞台上占有越來越大的位置。就在今年,國際知名的法國巴斯卡講座 (International Blaise Pascal Research Chair) 提名了第一位台灣科學家:陳丕燊教授。 台大陳丕燊教授:類比黑洞研究受人矚目 陳丕燊教授任職於國立台灣大學物理學系,並擔任台大梁次震宇宙與粒子天文物理學中心主任。研究範圍包括宇宙學、粒子天文物理學、極高能宇宙微中子探測、電漿物理及粒子束物理等。2017年,他與今年諾貝爾物理學獎得主 Gerard Mourou 教授共同設計、發表研究類比黑洞的實驗,也因為這項研究獲得世界知名的法國巴斯卡講座青睞,成為第一個獲得此項殊榮的台灣人。 巴斯卡講座由大巴黎政府於1996年資助設立,提供全世界頂尖的外籍科學家高達19萬歐元的研究資金,到巴黎的研究單位從事一年的研究及講學。陳丕燊教授將以此榮譽到世界頂尖的巴黎Ecole Polytechnique繼續黑洞研究,探討黑洞蒸發末期是否會有訊息遺失的現象,進而探索「黑洞資訊悖論」的真偽。…