投稿準備, 論文發表

生物化學期刊作者投稿須知

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大多數期刊都會提供作者「投稿須知」,作為撰稿及投稿時的參考依據。這些資訊通常會公告在各期刊的官方網站上。投稿須知一般會包括下列幾項重點:

(1) 一般性訊息
(2) 初稿主要內文之準備
(3) 圖示或附圖之準備
(4) 表格之準備
(5) 附加檔案之準備
(6) 文體及語言

我們下列將以BMC Biochemistry 為例,針對其「投稿須知」的一般性訊息及初稿主要內文之準備訊息分別詳述。

(1)    一般性訊息

一般性訊息主要提供作者,包括投稿過程、出版及同儕審閱流程、版面費(文稿處理費),以及編輯策略等詳盡資訊。

投稿過程

  • 投稿方式:線上投稿或郵寄投稿?

關於投稿過程,大多數期刊會要求由其中一位作者負責投稿,並在同儕審查期間,負責接收意見及回應。投稿方式依期刊要求,以BMC Biochemistry為例,採用線上投稿,以降低成本。線上投稿相關檔案,可以一整組或個別檔案分開上傳,操作上也允許中途暫停,只要事後回到原步驟繼續完成即可。

依期刊要求,以BMC Biochemistry為例,不同形式的附加檔案,包括影片、動畫、原始數據檔,皆可上傳作為發表出版的一部分。

投稿須有封面信 (cover letter),應於封面信中說明投稿論文之重要性、為何這篇論文應該被發表、任何與編輯策略相符合的要素,以及審稿時可能的競爭因素與利益迴避等。期刊網站也會提供專業諮詢,以及免費作者寫作工具 (Tools for Authors) 的服務。

發表與同儕審查流程

  • 是否進入審查流程:論文品質的基本要求

論文初稿通常會寄給同儕審查,除非內容性質不符、未達期刊設定之門檻,或是表達方式、英文寫作未達最低標準。論文初稿通常會寄給二~三位專家審查,目的是希望能盡快有所決定。審查委員須表明是否有任何競爭利益。

  • 審查與通過標準:科學知識拓展、領域貢獻、評審意見

同儕審查標準依照期刊策略,所發表之論文需連貫而完整促進並提升科學知識,並對該領域產生實質貢獻。審查委員須提供專業審查意見,並說明論文寫作品質可否被接受。論文審查結果,在審查委員意見一致同意時,或者至少無重大歧見時,即可作為同意論文發表之基礎。萬一審查委員間的審查意見不一致,或審查委員與作者間的意見不一致時,則須送交期刊編輯委員會審查並提出建議。每一份論文初稿最多容許修正兩次,作者的任何意見申訴,皆由握有最終決定權的期刊生物組編輯委員負責受理。

  • 審查通過與發表:論文的重要性與發行方式

審查委員認為極具重要性或高度有興趣的論文,期刊將會給予能見度更高的發表機會,以利讓更多讀者接觸到這篇文章。也會徵詢作者是否願意優先發表在BMC Biology。

論文一旦被接受發表,將會以PDF檔案及可在網路上瀏覽之web 形式發表於BMC Biochemistry期刊,可在BioMed 及PubMed 網路系統中搜尋到。

版面費

  • 收費標準與優惠方案:分為非會員、正式會員、支持會員及低收入國家

以BMC Biochemistry為例,2011年版面費為1175英鎊/1870美元/1355歐元。如果論文發表的研究機構為BioMed Central之正式會員,則會員費已包含了版面費。如果論文發表的研究機構為BioMed Central之支持會員,則版面費可享打折優惠。對於低收入國家之論文,照例會免除版面費。很多期刊都有類似的方案。

編輯策略

  • 重複性、著作權、人體與動物實驗規範

以下為常見之期刊編輯策略:以BMC Biochemistry為例,所投稿論文之全部或部分內容,皆不能出現於其他期刊,或是正被其他期刊考慮中。投稿之論文也必須保證無侵犯第三者著作權。作者發表於BMC Biochemistry之論文,擁有該文之著作權。所投稿之論文內容,會被視為已經全體作者閱讀過,而所進行的研究工作,也須經過適當的倫理委員會同意。人體實驗必須遵守赫爾辛基宣言 (Helsinki Declaration),而動物實驗也必須遵守國際規範準則。相關陳述必須出現在實驗方法的段落中。

法律維護、利益聲明、公共資產

期刊本身絕對不會發表侵害著作權,或是有損害名譽之嫌的論文。如有類似情形,編輯委員會將介入協調,加以改善避免。學名藥的名稱可以直接使用,應在實驗方法段落中以括弧附註說明。期刊通常也會要求作者聲明與所發表論文工作有關之競爭性財務利益。任何仍在出版中 (in press) 之引用參考文獻,期刊有權要求作者提供該文獻的原稿。

任何投稿論文,皆會自動被認為實驗經得起重複檢驗,且可以公開給科學界從事非商業性質之研究。

核酸、蛋白質、原子座標資料庫

核酸序列、蛋白質序列及原子座標等資料,應先寄存於國際資料庫,並先行取得查詢號碼 (accession number)。

  • 核酸序列

核酸序列可以寄存於下列國際資料庫中:DDBJ (DNA Data Bank of Japan)、EMBL/DBI (European Molecular Biology Laboratory Nucleotide Sequence Database)或GenBank (National Center for Biotechnology Information) 。

  • 蛋白質序列

蛋白質序列可以寄存於下列國際資料庫中:SwissProtProtein Information Resource (PIR)。

  • 結構

結構可以寄存於下列國際資料庫中:蛋白質結構可以寄存於Worldwide Protein Data Bank,核酸結構可以寄存於Rutgers大學Nucleic Acid Database,有機化合物結構可以寄存於Cambridge Crystallographic Data Centre

  • 化學結構與生物活性檢測 (Assay)

化學物質結構可以寄存於PubChem Substance,化學物質之生物活性篩檢可以寄存於 PubChem BioAssay

  • 微陣列資料 (Microarray Data)

微陣列資料應符合Microarray Gene Expression Data Society所定之標準,並寄存於下列國際資料庫之一:ArrayExpress Gene Expression Omnibus (GEO) 或Center for Information Biology Gene Expression Database (CIBEX)。

  • 運算模型 (Computational modeling)

建議使用Systems Biology Markup Language 來準備化學反應模型,並寄存於 BioModels database。同時隨初稿以附件方式一併投稿。

  • 質體 (Plasmids ):

建議作者將質體用DNA或菌種方式儲存於非盈利機構Addgene,或哈佛大學質體國際資料庫 PlasmID

撤回與申訴

BioMed Central為出版倫理委員會 (COPE) 成員,作者對任何論文被撤回,卻關注其出版過程之申訴案件,皆可提至COPE處理。BioMed Central同時遵循世界醫學編輯協會World Association of Medical Editors (WAME) 之出版政策。

(2)    初稿主要內文之準備

初稿內文之準備須知重點,包括檔案格式、論文類型、研究論文之各段落說明、微軟word檔案模板。

檔案格式

  • 格式種類與轉換

以下數種文字檔案格式 (word processor file formats) 均可被接受:

  • Microsoft Word (DOC)
  • Rich text format (RTF)
  • Portable document format (PDF)
  • TeX/LaTeX (use BioMed Central’s TeX template)
  • DeVice Independent format (DVI)
  • Publicon Document (NB)

其他種類之字體格式,請先轉換為RTF 再上傳。注意圖檔請另以不同的影像檔(image files) 投稿,而不要附屬在DOC/ PDF/TEX/DVI檔案中。

論文類型

以BMC Biochemistry而言,論文可分為下列四種類型,在投稿時作者會被要求指定一種論文類型如下:

請先閱讀投稿須知中的詳細敘述,並依內容結構選擇最合適的論文類型,如仍有疑問,則歸類於研究論文。

研究論文之段落章節說明

  • 研究論文之初稿依序可細分為以下各部分
  • 標題頁 (Title page)
  • 摘要 (Abstract)
  • 背景資料 (Background)
  • 實驗結果 (Results)
  • 討論 (Discussion)
  • 結論 (Conclusions)
  • 方法 (Methods)(也可置於「背景資料」之後)
  • 縮寫對照表 (List of abbreviations used)
  • 作者之貢獻說明 (Authors’ contributions)
  • 作者基本資料 (Authors’ information)
  • 誌謝與計畫經費 (Acknowledgements and Funding )
  • 參考文獻 (References)
  • 附圖文字說明 (Figure legends)
  • 表格與說明 (Tables and captions)
  • 附加數據檔說明 (Description of additional data files)

查詢號碼 (accession number)

論文中所提及之核酸序列、蛋白質序列、原子座標等,皆應提供查詢號碼(accession number),並以中括弧括起來,例如:[EMBL: AB026295, EMBL: AC137000, DDBJ: AE000812, GenBank: U49845, PDB: 1BFM, Swiss-Prot: Q96KQ7, PIR: S66116]。

除了上列所詳細敘述的細節之外,在BMC Biochemistry 的「投稿須知」中,另外還有圖示或附圖、表格、附加檔案、文體及語言等重點,皆需要在投稿前,特別注意。

 

參考資料:

開放獲取期刊BMC Biochemistry之官方網站

本文內容主要譯自BMC Biochemistry「投稿須知」說明

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